Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cbx1P83917 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cbx1P83917 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cbx1P83917 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cbx1P83917 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cbx1P83917 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cbx1P83917 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cbx1P83917 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Cbx1P83917 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cbx1P83917 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cbx1P83917 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cbx1P83917 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cbx1P83917 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cbx1P83917 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cbx1P83917 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cbx1P83917 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cbx1P83917 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cbx1P83917 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cbx1P83917 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cbx1P83917 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cbx1P83917 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Cbx1P83917 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cbx1P83917 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cbx1P83917 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cbx1P83917 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cbx1P83917 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cbx1P83917 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Cbx1P83917 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cbx1P83917 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cbx1P83917 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cbx1P83917 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cbx1P83917 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cbx1P83917 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cbx1P83917 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cbx1P83917 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cbx1P83917 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cbx1P83917 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cbx1P83917 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cbx1P83917 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cbx1P83917 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cbx1P83917 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cbx1P83917 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cbx1P83917 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cbx1P83917 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cbx1P83917 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cbx1P83917 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cbx1P83917 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Cbx1P83917 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cbx1P83917 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cbx1P83917 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cbx1P83917 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cbx1P83917 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cbx1P83917 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cbx1P83917 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cbx1P83917 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cbx1P83917 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cbx1P83917 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cbx1P83917 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cbx1P83917 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cbx1P83917 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cbx1P83917 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cbx1P83917 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cbx1P83917 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cbx1P83917 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cbx1P83917 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cbx1P83917 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cbx1P83917 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cbx1P83917 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cbx1P83917 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cbx1P83917 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cbx1P83917 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cbx1P83917 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cbx1P83917 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cbx1P83917 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cbx1P83917 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cbx1P83917 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cbx1P83917 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cbx1P83917 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cbx1P83917 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cbx1P83917 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cbx1P83917 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cbx1P83917 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cbx1P83917 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cbx1P83917 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cbx1P83917 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cbx1P83917 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cbx1P83917 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cbx1P83917 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cbx1P83917 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cbx1P83917 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cbx1P83917 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cbx1P83917 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Cbx1P83917 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cbx1P83917 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cbx1P83917 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cbx1P83917 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cbx1P83917 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cbx1P83917 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cbx1P83917 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cbx1P83917 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms