Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gabpb2P81069 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gabpb2P81069 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gabpb2P81069 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Gabpb2P81069 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gabpb2P81069 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gabpb2P81069 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gabpb2P81069 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gabpb2P81069 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gabpb2P81069 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gabpb2P81069 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gabpb2P81069 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gabpb2P81069 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gabpb2P81069 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gabpb2P81069 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gabpb2P81069 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gabpb2P81069 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gabpb2P81069 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gabpb2P81069 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gabpb2P81069 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gabpb2P81069 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gabpb2P81069 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gabpb2P81069 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gabpb2P81069 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Gabpb2P81069 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gabpb2P81069 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gabpb2P81069 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gabpb2P81069 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gabpb2P81069 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gabpb2P81069 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gabpb2P81069 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gabpb2P81069 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Gabpb2P81069 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gabpb2P81069 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gabpb2P81069 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gabpb2P81069 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gabpb2P81069 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gabpb2P81069 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gabpb2P81069 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gabpb2P81069 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gabpb2P81069 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gabpb2P81069 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gabpb2P81069 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Gabpb2P81069 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gabpb2P81069 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gabpb2P81069 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gabpb2P81069 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gabpb2P81069 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gabpb2P81069 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gabpb2P81069 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Gabpb2P81069 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gabpb2P81069 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gabpb2P81069 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gabpb2P81069 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gabpb2P81069 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gabpb2P81069 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gabpb2P81069 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gabpb2P81069 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gabpb2P81069 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gabpb2P81069 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gabpb2P81069 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Gabpb2P81069 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gabpb2P81069 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gabpb2P81069 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gabpb2P81069 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gabpb2P81069 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gabpb2P81069 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gabpb2P81069 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gabpb2P81069 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gabpb2P81069 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gabpb2P81069 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gabpb2P81069 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gabpb2P81069 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gabpb2P81069 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gabpb2P81069 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gabpb2P81069 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gabpb2P81069 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gabpb2P81069 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gabpb2P81069 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gabpb2P81069 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gabpb2P81069 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gabpb2P81069 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gabpb2P81069 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gabpb2P81069 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gabpb2P81069 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gabpb2P81069 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gabpb2P81069 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gabpb2P81069 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gabpb2P81069 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gabpb2P81069 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gabpb2P81069 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gabpb2P81069 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gabpb2P81069 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gabpb2P81069 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gabpb2P81069 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gabpb2P81069 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gabpb2P81069 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gabpb2P81069 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gabpb2P81069 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gabpb2P81069 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.2 ms