Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Irx2P81066 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Irx2P81066 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Irx2P81066 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Irx2P81066 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Irx2P81066 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Irx2P81066 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Irx2P81066 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Irx2P81066 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Irx2P81066 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Irx2P81066 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Irx2P81066 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Irx2P81066 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Irx2P81066 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Irx2P81066 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Irx2P81066 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Irx2P81066 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Irx2P81066 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Irx2P81066 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Irx2P81066 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Irx2P81066 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Irx2P81066 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Irx2P81066 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Irx2P81066 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Irx2P81066 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Irx2P81066 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Irx2P81066 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Irx2P81066 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Irx2P81066 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Irx2P81066 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Irx2P81066 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Irx2P81066 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Irx2P81066 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Irx2P81066 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Irx2P81066 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Irx2P81066 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Irx2P81066 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Irx2P81066 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Irx2P81066 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Irx2P81066 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Irx2P81066 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Irx2P81066 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Irx2P81066 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Irx2P81066 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Irx2P81066 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Irx2P81066 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Irx2P81066 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Irx2P81066 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Irx2P81066 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Irx2P81066 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Irx2P81066 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Irx2P81066 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Irx2P81066 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Irx2P81066 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Irx2P81066 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Irx2P81066 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Irx2P81066 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Irx2P81066 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Irx2P81066 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Irx2P81066 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Irx2P81066 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Irx2P81066 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Irx2P81066 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Irx2P81066 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Irx2P81066 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Irx2P81066 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Irx2P81066 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Irx2P81066 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Irx2P81066 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Irx2P81066 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Irx2P81066 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Irx2P81066 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Irx2P81066 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Irx2P81066 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Irx2P81066 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Irx2P81066 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Irx2P81066 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Irx2P81066 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Irx2P81066 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Irx2P81066 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Irx2P81066 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Irx2P81066 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Irx2P81066 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Irx2P81066 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Irx2P81066 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Irx2P81066 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Irx2P81066 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Irx2P81066 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Irx2P81066 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Irx2P81066 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Irx2P81066 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Irx2P81066 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Irx2P81066 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Irx2P81066 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Irx2P81066 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Irx2P81066 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Irx2P81066 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Irx2P81066 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Irx2P81066 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Irx2P81066 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113 ms