Protein–RNA interactions for Protein: P70677

Casp3, Caspase-3, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp3P70677 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Casp3P70677 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Casp3P70677 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Casp3P70677 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Casp3P70677 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Casp3P70677 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Casp3P70677 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Casp3P70677 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Casp3P70677 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Casp3P70677 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Casp3P70677 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Casp3P70677 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Casp3P70677 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Casp3P70677 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Casp3P70677 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Casp3P70677 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Casp3P70677 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Casp3P70677 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Casp3P70677 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Casp3P70677 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Casp3P70677 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Casp3P70677 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Casp3P70677 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Casp3P70677 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Casp3P70677 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Casp3P70677 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Casp3P70677 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Casp3P70677 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Casp3P70677 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Casp3P70677 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Casp3P70677 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Casp3P70677 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Casp3P70677 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Casp3P70677 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Casp3P70677 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Casp3P70677 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Casp3P70677 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Casp3P70677 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Casp3P70677 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Casp3P70677 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Casp3P70677 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Casp3P70677 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Casp3P70677 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Casp3P70677 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Casp3P70677 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Casp3P70677 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Casp3P70677 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Casp3P70677 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Casp3P70677 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Casp3P70677 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Casp3P70677 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Casp3P70677 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Casp3P70677 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Casp3P70677 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Casp3P70677 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Casp3P70677 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Casp3P70677 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Casp3P70677 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Casp3P70677 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Casp3P70677 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Casp3P70677 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Casp3P70677 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Casp3P70677 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Casp3P70677 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Casp3P70677 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Casp3P70677 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Casp3P70677 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Casp3P70677 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Casp3P70677 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Casp3P70677 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Casp3P70677 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Casp3P70677 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Casp3P70677 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Casp3P70677 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Casp3P70677 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Casp3P70677 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Casp3P70677 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Casp3P70677 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Casp3P70677 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Casp3P70677 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Casp3P70677 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Casp3P70677 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Casp3P70677 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Casp3P70677 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Casp3P70677 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Casp3P70677 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Casp3P70677 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Casp3P70677 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Casp3P70677 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Casp3P70677 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Casp3P70677 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Casp3P70677 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Casp3P70677 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Casp3P70677 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Casp3P70677 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Casp3P70677 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Casp3P70677 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Casp3P70677 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Casp3P70677 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Casp3P70677 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms