Protein–RNA interactions for Protein: P70321

Hoxb13, Homeobox protein Hox-B13, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb13P70321 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hoxb13P70321 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hoxb13P70321 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hoxb13P70321 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hoxb13P70321 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hoxb13P70321 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Hoxb13P70321 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Hoxb13P70321 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hoxb13P70321 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Hoxb13P70321 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Hoxb13P70321 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hoxb13P70321 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hoxb13P70321 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hoxb13P70321 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hoxb13P70321 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hoxb13P70321 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hoxb13P70321 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Hoxb13P70321 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hoxb13P70321 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hoxb13P70321 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hoxb13P70321 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hoxb13P70321 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hoxb13P70321 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hoxb13P70321 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hoxb13P70321 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hoxb13P70321 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hoxb13P70321 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hoxb13P70321 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hoxb13P70321 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hoxb13P70321 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hoxb13P70321 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hoxb13P70321 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hoxb13P70321 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hoxb13P70321 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hoxb13P70321 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hoxb13P70321 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hoxb13P70321 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hoxb13P70321 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hoxb13P70321 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hoxb13P70321 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hoxb13P70321 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hoxb13P70321 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hoxb13P70321 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hoxb13P70321 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hoxb13P70321 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hoxb13P70321 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hoxb13P70321 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hoxb13P70321 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hoxb13P70321 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hoxb13P70321 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hoxb13P70321 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hoxb13P70321 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hoxb13P70321 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hoxb13P70321 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hoxb13P70321 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hoxb13P70321 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hoxb13P70321 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hoxb13P70321 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hoxb13P70321 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hoxb13P70321 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hoxb13P70321 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hoxb13P70321 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hoxb13P70321 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hoxb13P70321 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hoxb13P70321 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Hoxb13P70321 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Hoxb13P70321 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hoxb13P70321 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Hoxb13P70321 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hoxb13P70321 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hoxb13P70321 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hoxb13P70321 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hoxb13P70321 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hoxb13P70321 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hoxb13P70321 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hoxb13P70321 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hoxb13P70321 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Hoxb13P70321 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hoxb13P70321 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hoxb13P70321 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hoxb13P70321 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hoxb13P70321 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hoxb13P70321 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Hoxb13P70321 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Hoxb13P70321 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hoxb13P70321 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Hoxb13P70321 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Hoxb13P70321 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hoxb13P70321 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hoxb13P70321 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hoxb13P70321 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hoxb13P70321 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hoxb13P70321 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hoxb13P70321 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hoxb13P70321 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hoxb13P70321 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hoxb13P70321 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hoxb13P70321 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hoxb13P70321 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hoxb13P70321 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130.3 ms