Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pkn1P70268 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pkn1P70268 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pkn1P70268 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pkn1P70268 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pkn1P70268 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pkn1P70268 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pkn1P70268 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pkn1P70268 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pkn1P70268 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pkn1P70268 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pkn1P70268 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pkn1P70268 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pkn1P70268 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pkn1P70268 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pkn1P70268 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pkn1P70268 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Pkn1P70268 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Pkn1P70268 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pkn1P70268 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pkn1P70268 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pkn1P70268 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pkn1P70268 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Pkn1P70268 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Pkn1P70268 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pkn1P70268 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pkn1P70268 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pkn1P70268 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pkn1P70268 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pkn1P70268 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pkn1P70268 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pkn1P70268 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pkn1P70268 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pkn1P70268 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pkn1P70268 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pkn1P70268 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pkn1P70268 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pkn1P70268 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pkn1P70268 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pkn1P70268 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pkn1P70268 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pkn1P70268 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pkn1P70268 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pkn1P70268 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pkn1P70268 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pkn1P70268 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pkn1P70268 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pkn1P70268 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pkn1P70268 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pkn1P70268 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pkn1P70268 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pkn1P70268 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pkn1P70268 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pkn1P70268 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pkn1P70268 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pkn1P70268 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pkn1P70268 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pkn1P70268 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pkn1P70268 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pkn1P70268 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pkn1P70268 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pkn1P70268 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pkn1P70268 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pkn1P70268 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pkn1P70268 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pkn1P70268 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pkn1P70268 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Pkn1P70268 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pkn1P70268 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pkn1P70268 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pkn1P70268 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pkn1P70268 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pkn1P70268 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pkn1P70268 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pkn1P70268 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pkn1P70268 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pkn1P70268 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pkn1P70268 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pkn1P70268 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pkn1P70268 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pkn1P70268 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pkn1P70268 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pkn1P70268 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pkn1P70268 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pkn1P70268 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pkn1P70268 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pkn1P70268 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pkn1P70268 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pkn1P70268 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pkn1P70268 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pkn1P70268 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Pkn1P70268 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pkn1P70268 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Pkn1P70268 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pkn1P70268 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Pkn1P70268 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pkn1P70268 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pkn1P70268 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Pkn1P70268 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pkn1P70268 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms