Protein–RNA interactions for Protein: P70190

Capza3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capza3P70190 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Capza3P70190 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Capza3P70190 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Capza3P70190 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Capza3P70190 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Capza3P70190 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Capza3P70190 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Capza3P70190 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Capza3P70190 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Capza3P70190 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Capza3P70190 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Capza3P70190 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Capza3P70190 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Capza3P70190 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Capza3P70190 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Capza3P70190 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Capza3P70190 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Capza3P70190 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Capza3P70190 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Capza3P70190 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Capza3P70190 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Capza3P70190 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Capza3P70190 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Capza3P70190 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Capza3P70190 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Capza3P70190 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Capza3P70190 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Capza3P70190 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Capza3P70190 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Capza3P70190 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Capza3P70190 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Capza3P70190 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Capza3P70190 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Capza3P70190 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Capza3P70190 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Capza3P70190 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Capza3P70190 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Capza3P70190 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Capza3P70190 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Capza3P70190 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Capza3P70190 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Capza3P70190 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Capza3P70190 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Capza3P70190 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Capza3P70190 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Capza3P70190 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Capza3P70190 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Capza3P70190 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Capza3P70190 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Capza3P70190 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Capza3P70190 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Capza3P70190 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Capza3P70190 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Capza3P70190 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Capza3P70190 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Capza3P70190 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Capza3P70190 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Capza3P70190 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Capza3P70190 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Capza3P70190 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Capza3P70190 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Capza3P70190 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Capza3P70190 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Capza3P70190 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Capza3P70190 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Capza3P70190 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Capza3P70190 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Capza3P70190 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Capza3P70190 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Capza3P70190 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Capza3P70190 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Capza3P70190 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Capza3P70190 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Capza3P70190 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Capza3P70190 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Capza3P70190 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Capza3P70190 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Capza3P70190 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Capza3P70190 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Capza3P70190 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Capza3P70190 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Capza3P70190 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Capza3P70190 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Capza3P70190 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Capza3P70190 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Capza3P70190 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Capza3P70190 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Capza3P70190 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Capza3P70190 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Capza3P70190 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Capza3P70190 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Capza3P70190 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Capza3P70190 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Capza3P70190 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Capza3P70190 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Capza3P70190 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Capza3P70190 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Capza3P70190 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Capza3P70190 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Capza3P70190 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms