Protein–RNA interactions for Protein: P62754

Rps6, 40S ribosomal protein S6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6P62754 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rps6P62754 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rps6P62754 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rps6P62754 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rps6P62754 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rps6P62754 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rps6P62754 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rps6P62754 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rps6P62754 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rps6P62754 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rps6P62754 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rps6P62754 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rps6P62754 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rps6P62754 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Rps6P62754 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rps6P62754 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rps6P62754 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rps6P62754 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rps6P62754 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rps6P62754 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rps6P62754 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rps6P62754 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rps6P62754 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rps6P62754 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rps6P62754 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rps6P62754 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rps6P62754 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rps6P62754 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rps6P62754 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rps6P62754 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rps6P62754 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rps6P62754 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rps6P62754 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rps6P62754 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Rps6P62754 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rps6P62754 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rps6P62754 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rps6P62754 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rps6P62754 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rps6P62754 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Rps6P62754 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rps6P62754 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rps6P62754 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rps6P62754 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rps6P62754 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rps6P62754 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rps6P62754 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rps6P62754 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rps6P62754 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rps6P62754 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rps6P62754 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rps6P62754 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rps6P62754 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rps6P62754 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Rps6P62754 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rps6P62754 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rps6P62754 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rps6P62754 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rps6P62754 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rps6P62754 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rps6P62754 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rps6P62754 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rps6P62754 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rps6P62754 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rps6P62754 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rps6P62754 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rps6P62754 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rps6P62754 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rps6P62754 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Rps6P62754 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rps6P62754 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rps6P62754 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rps6P62754 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rps6P62754 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rps6P62754 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rps6P62754 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rps6P62754 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rps6P62754 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rps6P62754 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rps6P62754 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rps6P62754 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rps6P62754 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rps6P62754 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rps6P62754 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rps6P62754 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rps6P62754 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rps6P62754 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rps6P62754 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rps6P62754 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rps6P62754 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Rps6P62754 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rps6P62754 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rps6P62754 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Rps6P62754 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rps6P62754 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rps6P62754 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rps6P62754 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rps6P62754 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rps6P62754 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rps6P62754 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms