Protein–RNA interactions for Protein: P61924

Copz1, Coatomer subunit zeta-1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz1P61924 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Copz1P61924 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Copz1P61924 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Copz1P61924 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Copz1P61924 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Copz1P61924 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Copz1P61924 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Copz1P61924 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Copz1P61924 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Copz1P61924 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Copz1P61924 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Copz1P61924 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Copz1P61924 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Copz1P61924 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Copz1P61924 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Copz1P61924 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Copz1P61924 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Copz1P61924 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Copz1P61924 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Copz1P61924 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Copz1P61924 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Copz1P61924 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Copz1P61924 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Copz1P61924 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Copz1P61924 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Copz1P61924 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Copz1P61924 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Copz1P61924 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Copz1P61924 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Copz1P61924 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Copz1P61924 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Copz1P61924 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Copz1P61924 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Copz1P61924 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Copz1P61924 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Copz1P61924 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Copz1P61924 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Copz1P61924 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Copz1P61924 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Copz1P61924 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Copz1P61924 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Copz1P61924 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Copz1P61924 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Copz1P61924 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Copz1P61924 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Copz1P61924 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Copz1P61924 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Copz1P61924 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Copz1P61924 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Copz1P61924 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Copz1P61924 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Copz1P61924 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Copz1P61924 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Copz1P61924 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Copz1P61924 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Copz1P61924 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Copz1P61924 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Copz1P61924 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Copz1P61924 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Copz1P61924 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Copz1P61924 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Copz1P61924 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Copz1P61924 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Copz1P61924 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Copz1P61924 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Copz1P61924 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Copz1P61924 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Copz1P61924 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Copz1P61924 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Copz1P61924 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Copz1P61924 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Copz1P61924 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Copz1P61924 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Copz1P61924 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Copz1P61924 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Copz1P61924 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Copz1P61924 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Copz1P61924 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Copz1P61924 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Copz1P61924 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Copz1P61924 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Copz1P61924 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Copz1P61924 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Copz1P61924 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Copz1P61924 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Copz1P61924 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Copz1P61924 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Copz1P61924 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Copz1P61924 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Copz1P61924 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Copz1P61924 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Copz1P61924 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Copz1P61924 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Copz1P61924 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Copz1P61924 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Copz1P61924 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Copz1P61924 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Copz1P61924 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Copz1P61924 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Copz1P61924 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms