Protein–RNA interactions for Protein: P61460

Depdc5, GATOR complex protein DEPDC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depdc5P61460 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
Depdc5P61460 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Depdc5P61460 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Depdc5P61460 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Depdc5P61460 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Depdc5P61460 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Depdc5P61460 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Depdc5P61460 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Depdc5P61460 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Depdc5P61460 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Depdc5P61460 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Depdc5P61460 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Depdc5P61460 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Depdc5P61460 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Depdc5P61460 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
Depdc5P61460 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Depdc5P61460 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Depdc5P61460 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
Depdc5P61460 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Depdc5P61460 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Depdc5P61460 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Depdc5P61460 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
Depdc5P61460 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
Depdc5P61460 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Depdc5P61460 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Depdc5P61460 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Depdc5P61460 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Depdc5P61460 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Depdc5P61460 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Depdc5P61460 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Depdc5P61460 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Depdc5P61460 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Depdc5P61460 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Depdc5P61460 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Depdc5P61460 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC34.7■■■■□ 3.15
Depdc5P61460 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.14
Depdc5P61460 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.14
Depdc5P61460 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.14
Depdc5P61460 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Depdc5P61460 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
Depdc5P61460 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
Depdc5P61460 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Depdc5P61460 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Depdc5P61460 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Depdc5P61460 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Depdc5P61460 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Depdc5P61460 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Depdc5P61460 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Depdc5P61460 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Depdc5P61460 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Depdc5P61460 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
Depdc5P61460 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Depdc5P61460 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Depdc5P61460 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Depdc5P61460 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Depdc5P61460 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Depdc5P61460 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Depdc5P61460 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Depdc5P61460 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Depdc5P61460 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Depdc5P61460 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Depdc5P61460 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Depdc5P61460 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Depdc5P61460 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Depdc5P61460 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Depdc5P61460 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Depdc5P61460 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Depdc5P61460 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Depdc5P61460 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Depdc5P61460 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Depdc5P61460 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Depdc5P61460 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Depdc5P61460 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC34.57■■■■□ 3.13
Depdc5P61460 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
Depdc5P61460 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Depdc5P61460 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
Depdc5P61460 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Depdc5P61460 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Depdc5P61460 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Depdc5P61460 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Depdc5P61460 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Depdc5P61460 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Depdc5P61460 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Depdc5P61460 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Depdc5P61460 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Depdc5P61460 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Depdc5P61460 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Depdc5P61460 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Depdc5P61460 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Depdc5P61460 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Depdc5P61460 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
Depdc5P61460 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Depdc5P61460 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Depdc5P61460 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Depdc5P61460 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Depdc5P61460 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Depdc5P61460 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Depdc5P61460 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Depdc5P61460 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Depdc5P61460 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms