Protein–RNA interactions for Protein: P59242

Cgn, Cingulin, mousemouse

Predictions only

Length 1,191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CgnP59242 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CgnP59242 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CgnP59242 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CgnP59242 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CgnP59242 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CgnP59242 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CgnP59242 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CgnP59242 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CgnP59242 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CgnP59242 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CgnP59242 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CgnP59242 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CgnP59242 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CgnP59242 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CgnP59242 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CgnP59242 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CgnP59242 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CgnP59242 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CgnP59242 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CgnP59242 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CgnP59242 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CgnP59242 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CgnP59242 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CgnP59242 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CgnP59242 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CgnP59242 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CgnP59242 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CgnP59242 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CgnP59242 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CgnP59242 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CgnP59242 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CgnP59242 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CgnP59242 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CgnP59242 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CgnP59242 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CgnP59242 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CgnP59242 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CgnP59242 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CgnP59242 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CgnP59242 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CgnP59242 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CgnP59242 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CgnP59242 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CgnP59242 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CgnP59242 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CgnP59242 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CgnP59242 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CgnP59242 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CgnP59242 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CgnP59242 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CgnP59242 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CgnP59242 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CgnP59242 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CgnP59242 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CgnP59242 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CgnP59242 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CgnP59242 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CgnP59242 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CgnP59242 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CgnP59242 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CgnP59242 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CgnP59242 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CgnP59242 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CgnP59242 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CgnP59242 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CgnP59242 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CgnP59242 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CgnP59242 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CgnP59242 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CgnP59242 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CgnP59242 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CgnP59242 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CgnP59242 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CgnP59242 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CgnP59242 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CgnP59242 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CgnP59242 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CgnP59242 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CgnP59242 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CgnP59242 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CgnP59242 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CgnP59242 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CgnP59242 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CgnP59242 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CgnP59242 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CgnP59242 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CgnP59242 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CgnP59242 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CgnP59242 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CgnP59242 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CgnP59242 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CgnP59242 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CgnP59242 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CgnP59242 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CgnP59242 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CgnP59242 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CgnP59242 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CgnP59242 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CgnP59242 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CgnP59242 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 219.4 ms