Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Csrnp3P59055 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Csrnp3P59055 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
Csrnp3P59055 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Csrnp3P59055 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Csrnp3P59055 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Csrnp3P59055 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
Csrnp3P59055 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Csrnp3P59055 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Csrnp3P59055 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
Csrnp3P59055 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Csrnp3P59055 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Csrnp3P59055 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Csrnp3P59055 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Csrnp3P59055 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Csrnp3P59055 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Csrnp3P59055 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Csrnp3P59055 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Csrnp3P59055 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Csrnp3P59055 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Csrnp3P59055 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
Csrnp3P59055 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Csrnp3P59055 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Csrnp3P59055 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Csrnp3P59055 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Csrnp3P59055 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Csrnp3P59055 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Csrnp3P59055 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Csrnp3P59055 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Csrnp3P59055 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
Csrnp3P59055 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Csrnp3P59055 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Csrnp3P59055 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Csrnp3P59055 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Csrnp3P59055 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Csrnp3P59055 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
Csrnp3P59055 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Csrnp3P59055 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Csrnp3P59055 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Csrnp3P59055 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Csrnp3P59055 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Csrnp3P59055 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Csrnp3P59055 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Csrnp3P59055 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Csrnp3P59055 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Csrnp3P59055 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Csrnp3P59055 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Csrnp3P59055 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Csrnp3P59055 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Csrnp3P59055 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Csrnp3P59055 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Csrnp3P59055 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
Csrnp3P59055 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Csrnp3P59055 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Csrnp3P59055 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Csrnp3P59055 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Csrnp3P59055 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Csrnp3P59055 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Csrnp3P59055 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Csrnp3P59055 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Csrnp3P59055 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Csrnp3P59055 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Csrnp3P59055 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Csrnp3P59055 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Csrnp3P59055 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Csrnp3P59055 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Csrnp3P59055 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Csrnp3P59055 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Csrnp3P59055 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
Csrnp3P59055 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
Csrnp3P59055 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.42
Csrnp3P59055 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Csrnp3P59055 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Csrnp3P59055 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Csrnp3P59055 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Csrnp3P59055 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Csrnp3P59055 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Csrnp3P59055 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Csrnp3P59055 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Csrnp3P59055 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Csrnp3P59055 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Csrnp3P59055 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Csrnp3P59055 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Csrnp3P59055 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Csrnp3P59055 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Csrnp3P59055 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Csrnp3P59055 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Csrnp3P59055 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Csrnp3P59055 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Csrnp3P59055 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Csrnp3P59055 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Csrnp3P59055 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Csrnp3P59055 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Csrnp3P59055 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Csrnp3P59055 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Csrnp3P59055 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Csrnp3P59055 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Csrnp3P59055 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Csrnp3P59055 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Csrnp3P59055 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms