Protein–RNA interactions for Protein: P58390

Kcnn2, Small conductance calcium-activated potassium channel protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnn2P58390 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kcnn2P58390 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kcnn2P58390 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kcnn2P58390 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kcnn2P58390 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Kcnn2P58390 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Kcnn2P58390 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kcnn2P58390 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kcnn2P58390 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Kcnn2P58390 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Kcnn2P58390 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kcnn2P58390 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kcnn2P58390 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kcnn2P58390 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kcnn2P58390 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kcnn2P58390 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kcnn2P58390 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kcnn2P58390 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kcnn2P58390 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kcnn2P58390 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Kcnn2P58390 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kcnn2P58390 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kcnn2P58390 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kcnn2P58390 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Kcnn2P58390 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kcnn2P58390 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kcnn2P58390 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kcnn2P58390 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Kcnn2P58390 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kcnn2P58390 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Kcnn2P58390 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kcnn2P58390 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kcnn2P58390 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kcnn2P58390 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kcnn2P58390 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kcnn2P58390 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kcnn2P58390 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kcnn2P58390 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kcnn2P58390 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Kcnn2P58390 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kcnn2P58390 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kcnn2P58390 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Kcnn2P58390 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kcnn2P58390 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kcnn2P58390 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kcnn2P58390 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Kcnn2P58390 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kcnn2P58390 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kcnn2P58390 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kcnn2P58390 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kcnn2P58390 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kcnn2P58390 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kcnn2P58390 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kcnn2P58390 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kcnn2P58390 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kcnn2P58390 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kcnn2P58390 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kcnn2P58390 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kcnn2P58390 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kcnn2P58390 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kcnn2P58390 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kcnn2P58390 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kcnn2P58390 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kcnn2P58390 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kcnn2P58390 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kcnn2P58390 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kcnn2P58390 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kcnn2P58390 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kcnn2P58390 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kcnn2P58390 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kcnn2P58390 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kcnn2P58390 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kcnn2P58390 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kcnn2P58390 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kcnn2P58390 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kcnn2P58390 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kcnn2P58390 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kcnn2P58390 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kcnn2P58390 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kcnn2P58390 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kcnn2P58390 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kcnn2P58390 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kcnn2P58390 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kcnn2P58390 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kcnn2P58390 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kcnn2P58390 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kcnn2P58390 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kcnn2P58390 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kcnn2P58390 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kcnn2P58390 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kcnn2P58390 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Kcnn2P58390 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Kcnn2P58390 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kcnn2P58390 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kcnn2P58390 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kcnn2P58390 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kcnn2P58390 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kcnn2P58390 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kcnn2P58390 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kcnn2P58390 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms