Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Samsn1P57725 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Samsn1P57725 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Samsn1P57725 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Samsn1P57725 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Samsn1P57725 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Samsn1P57725 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Samsn1P57725 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Samsn1P57725 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Samsn1P57725 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Samsn1P57725 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Samsn1P57725 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Samsn1P57725 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Samsn1P57725 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Samsn1P57725 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Samsn1P57725 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Samsn1P57725 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Samsn1P57725 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Samsn1P57725 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Samsn1P57725 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Samsn1P57725 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Samsn1P57725 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Samsn1P57725 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Samsn1P57725 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Samsn1P57725 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Samsn1P57725 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Samsn1P57725 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Samsn1P57725 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Samsn1P57725 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Samsn1P57725 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Samsn1P57725 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Samsn1P57725 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Samsn1P57725 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Samsn1P57725 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Samsn1P57725 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Samsn1P57725 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Samsn1P57725 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Samsn1P57725 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Samsn1P57725 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Samsn1P57725 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Samsn1P57725 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Samsn1P57725 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Samsn1P57725 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Samsn1P57725 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Samsn1P57725 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Samsn1P57725 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Samsn1P57725 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Samsn1P57725 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Samsn1P57725 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Samsn1P57725 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Samsn1P57725 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Samsn1P57725 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Samsn1P57725 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Samsn1P57725 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Samsn1P57725 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Samsn1P57725 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Samsn1P57725 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Samsn1P57725 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Samsn1P57725 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Samsn1P57725 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Samsn1P57725 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Samsn1P57725 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Samsn1P57725 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Samsn1P57725 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Samsn1P57725 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Samsn1P57725 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Samsn1P57725 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Samsn1P57725 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Samsn1P57725 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Samsn1P57725 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Samsn1P57725 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Samsn1P57725 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Samsn1P57725 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Samsn1P57725 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Samsn1P57725 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Samsn1P57725 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Samsn1P57725 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Samsn1P57725 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Samsn1P57725 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Samsn1P57725 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Samsn1P57725 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Samsn1P57725 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Samsn1P57725 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Samsn1P57725 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Samsn1P57725 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Samsn1P57725 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Samsn1P57725 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Samsn1P57725 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Samsn1P57725 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Samsn1P57725 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Samsn1P57725 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Samsn1P57725 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Samsn1P57725 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Samsn1P57725 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Samsn1P57725 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Samsn1P57725 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Samsn1P57725 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Samsn1P57725 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Samsn1P57725 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Samsn1P57725 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms