Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cldn18P56857 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cldn18P56857 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cldn18P56857 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cldn18P56857 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cldn18P56857 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cldn18P56857 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cldn18P56857 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cldn18P56857 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cldn18P56857 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cldn18P56857 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cldn18P56857 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cldn18P56857 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cldn18P56857 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cldn18P56857 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cldn18P56857 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cldn18P56857 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cldn18P56857 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cldn18P56857 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cldn18P56857 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cldn18P56857 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cldn18P56857 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cldn18P56857 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cldn18P56857 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cldn18P56857 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cldn18P56857 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cldn18P56857 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cldn18P56857 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cldn18P56857 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn18P56857 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn18P56857 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn18P56857 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn18P56857 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn18P56857 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn18P56857 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn18P56857 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn18P56857 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn18P56857 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn18P56857 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn18P56857 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn18P56857 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn18P56857 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn18P56857 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn18P56857 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn18P56857 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn18P56857 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn18P56857 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn18P56857 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn18P56857 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn18P56857 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn18P56857 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn18P56857 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn18P56857 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn18P56857 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn18P56857 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn18P56857 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn18P56857 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn18P56857 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn18P56857 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn18P56857 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn18P56857 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn18P56857 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cldn18P56857 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn18P56857 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn18P56857 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn18P56857 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn18P56857 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn18P56857 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn18P56857 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn18P56857 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn18P56857 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn18P56857 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn18P56857 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn18P56857 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn18P56857 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn18P56857 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn18P56857 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn18P56857 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn18P56857 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn18P56857 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn18P56857 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn18P56857 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn18P56857 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cldn18P56857 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cldn18P56857 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cldn18P56857 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cldn18P56857 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cldn18P56857 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cldn18P56857 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cldn18P56857 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cldn18P56857 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cldn18P56857 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cldn18P56857 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cldn18P56857 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cldn18P56857 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cldn18P56857 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cldn18P56857 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cldn18P56857 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cldn18P56857 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Cldn18P56857 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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