Protein–RNA interactions for Protein: P54763

Ephb2, Ephrin type-B receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 986 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb2P54763 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ephb2P54763 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ephb2P54763 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ephb2P54763 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ephb2P54763 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ephb2P54763 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ephb2P54763 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ephb2P54763 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ephb2P54763 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ephb2P54763 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ephb2P54763 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ephb2P54763 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ephb2P54763 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ephb2P54763 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ephb2P54763 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ephb2P54763 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ephb2P54763 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ephb2P54763 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ephb2P54763 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ephb2P54763 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ephb2P54763 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ephb2P54763 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ephb2P54763 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ephb2P54763 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ephb2P54763 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ephb2P54763 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ephb2P54763 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ephb2P54763 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ephb2P54763 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ephb2P54763 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ephb2P54763 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ephb2P54763 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ephb2P54763 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ephb2P54763 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ephb2P54763 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ephb2P54763 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ephb2P54763 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ephb2P54763 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ephb2P54763 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ephb2P54763 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ephb2P54763 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ephb2P54763 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ephb2P54763 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ephb2P54763 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ephb2P54763 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ephb2P54763 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ephb2P54763 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ephb2P54763 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ephb2P54763 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ephb2P54763 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ephb2P54763 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ephb2P54763 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ephb2P54763 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ephb2P54763 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ephb2P54763 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ephb2P54763 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ephb2P54763 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ephb2P54763 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ephb2P54763 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ephb2P54763 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ephb2P54763 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ephb2P54763 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ephb2P54763 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ephb2P54763 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ephb2P54763 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ephb2P54763 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ephb2P54763 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ephb2P54763 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ephb2P54763 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ephb2P54763 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ephb2P54763 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ephb2P54763 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ephb2P54763 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ephb2P54763 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ephb2P54763 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ephb2P54763 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ephb2P54763 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ephb2P54763 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ephb2P54763 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ephb2P54763 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ephb2P54763 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ephb2P54763 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ephb2P54763 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ephb2P54763 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Ephb2P54763 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Ephb2P54763 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ephb2P54763 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ephb2P54763 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ephb2P54763 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ephb2P54763 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ephb2P54763 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ephb2P54763 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ephb2P54763 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ephb2P54763 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ephb2P54763 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ephb2P54763 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ephb2P54763 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ephb2P54763 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ephb2P54763 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ephb2P54763 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms