Protein–RNA interactions for Protein: P50706

Defa8, Alpha-defensin 8 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa8P50706 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Defa8P50706 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Defa8P50706 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Defa8P50706 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Defa8P50706 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Defa8P50706 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Defa8P50706 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Defa8P50706 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Defa8P50706 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Defa8P50706 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Defa8P50706 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Defa8P50706 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Defa8P50706 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Defa8P50706 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Defa8P50706 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Defa8P50706 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Defa8P50706 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Defa8P50706 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Defa8P50706 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Defa8P50706 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Defa8P50706 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Defa8P50706 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Defa8P50706 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Defa8P50706 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Defa8P50706 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Defa8P50706 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Defa8P50706 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Defa8P50706 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Defa8P50706 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Defa8P50706 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Defa8P50706 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Defa8P50706 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Defa8P50706 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Defa8P50706 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Defa8P50706 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Defa8P50706 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Defa8P50706 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Defa8P50706 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Defa8P50706 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Defa8P50706 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Defa8P50706 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Defa8P50706 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Defa8P50706 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Defa8P50706 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Defa8P50706 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Defa8P50706 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Defa8P50706 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Defa8P50706 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Defa8P50706 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Defa8P50706 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Defa8P50706 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Defa8P50706 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Defa8P50706 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Defa8P50706 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Defa8P50706 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Defa8P50706 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Defa8P50706 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Defa8P50706 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Defa8P50706 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Defa8P50706 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Defa8P50706 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Defa8P50706 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Defa8P50706 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Defa8P50706 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Defa8P50706 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Defa8P50706 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Defa8P50706 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Defa8P50706 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Defa8P50706 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Defa8P50706 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Defa8P50706 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Defa8P50706 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Defa8P50706 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Defa8P50706 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Defa8P50706 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Defa8P50706 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Defa8P50706 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Defa8P50706 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Defa8P50706 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Defa8P50706 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Defa8P50706 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Defa8P50706 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Defa8P50706 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Defa8P50706 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Defa8P50706 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Defa8P50706 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Defa8P50706 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Defa8P50706 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Defa8P50706 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Defa8P50706 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Defa8P50706 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Defa8P50706 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Defa8P50706 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Defa8P50706 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Defa8P50706 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Defa8P50706 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Defa8P50706 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Defa8P50706 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Defa8P50706 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Defa8P50706 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms