Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa6P50704 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa6P50704 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa6P50704 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa6P50704 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa6P50704 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa6P50704 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa6P50704 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Defa6P50704 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Defa6P50704 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Defa6P50704 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Defa6P50704 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Defa6P50704 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Defa6P50704 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Defa6P50704 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Defa6P50704 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Defa6P50704 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Defa6P50704 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Defa6P50704 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Defa6P50704 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Defa6P50704 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Defa6P50704 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Defa6P50704 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Defa6P50704 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Defa6P50704 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Defa6P50704 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Defa6P50704 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Defa6P50704 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Defa6P50704 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Defa6P50704 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Defa6P50704 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Defa6P50704 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Defa6P50704 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Defa6P50704 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Defa6P50704 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Defa6P50704 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Defa6P50704 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Defa6P50704 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Defa6P50704 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Defa6P50704 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Defa6P50704 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa6P50704 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa6P50704 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa6P50704 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa6P50704 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa6P50704 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa6P50704 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa6P50704 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa6P50704 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa6P50704 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa6P50704 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa6P50704 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa6P50704 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa6P50704 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa6P50704 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa6P50704 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa6P50704 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa6P50704 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa6P50704 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa6P50704 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa6P50704 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa6P50704 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa6P50704 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa6P50704 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa6P50704 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa6P50704 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa6P50704 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa6P50704 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa6P50704 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa6P50704 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Defa6P50704 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa6P50704 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa6P50704 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa6P50704 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa6P50704 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa6P50704 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa6P50704 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa6P50704 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa6P50704 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa6P50704 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa6P50704 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa6P50704 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa6P50704 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa6P50704 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa6P50704 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa6P50704 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa6P50704 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa6P50704 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa6P50704 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa6P50704 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa6P50704 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa6P50704 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa6P50704 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa6P50704 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa6P50704 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa6P50704 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa6P50704 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa6P50704 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa6P50704 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa6P50704 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms