Protein–RNA interactions for Protein: P48432

Sox2, Transcription factor SOX-2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox2P48432 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sox2P48432 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sox2P48432 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sox2P48432 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sox2P48432 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sox2P48432 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sox2P48432 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Sox2P48432 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sox2P48432 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sox2P48432 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sox2P48432 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sox2P48432 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sox2P48432 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sox2P48432 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sox2P48432 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sox2P48432 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sox2P48432 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sox2P48432 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sox2P48432 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sox2P48432 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sox2P48432 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sox2P48432 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sox2P48432 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sox2P48432 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sox2P48432 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sox2P48432 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sox2P48432 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sox2P48432 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sox2P48432 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sox2P48432 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sox2P48432 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sox2P48432 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sox2P48432 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sox2P48432 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sox2P48432 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sox2P48432 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sox2P48432 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sox2P48432 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sox2P48432 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sox2P48432 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sox2P48432 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Sox2P48432 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Sox2P48432 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sox2P48432 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sox2P48432 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sox2P48432 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sox2P48432 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sox2P48432 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Sox2P48432 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sox2P48432 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sox2P48432 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sox2P48432 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sox2P48432 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sox2P48432 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sox2P48432 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sox2P48432 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sox2P48432 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sox2P48432 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sox2P48432 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sox2P48432 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sox2P48432 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sox2P48432 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sox2P48432 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sox2P48432 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sox2P48432 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sox2P48432 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sox2P48432 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sox2P48432 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Sox2P48432 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sox2P48432 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sox2P48432 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sox2P48432 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sox2P48432 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sox2P48432 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sox2P48432 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sox2P48432 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sox2P48432 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sox2P48432 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sox2P48432 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sox2P48432 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sox2P48432 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sox2P48432 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sox2P48432 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Sox2P48432 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Sox2P48432 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sox2P48432 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sox2P48432 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sox2P48432 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sox2P48432 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sox2P48432 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sox2P48432 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sox2P48432 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sox2P48432 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sox2P48432 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sox2P48432 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Sox2P48432 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sox2P48432 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sox2P48432 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sox2P48432 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sox2P48432 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms