Protein–RNA interactions for Protein: P48298

Ccl11, Eotaxin, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl11P48298 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccl11P48298 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccl11P48298 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccl11P48298 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccl11P48298 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccl11P48298 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccl11P48298 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccl11P48298 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccl11P48298 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccl11P48298 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccl11P48298 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccl11P48298 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccl11P48298 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccl11P48298 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccl11P48298 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccl11P48298 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccl11P48298 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccl11P48298 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccl11P48298 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccl11P48298 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccl11P48298 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccl11P48298 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccl11P48298 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccl11P48298 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccl11P48298 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccl11P48298 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccl11P48298 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccl11P48298 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccl11P48298 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccl11P48298 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccl11P48298 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccl11P48298 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccl11P48298 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccl11P48298 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccl11P48298 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccl11P48298 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccl11P48298 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccl11P48298 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccl11P48298 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccl11P48298 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccl11P48298 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccl11P48298 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccl11P48298 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccl11P48298 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccl11P48298 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccl11P48298 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccl11P48298 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccl11P48298 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccl11P48298 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccl11P48298 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccl11P48298 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccl11P48298 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccl11P48298 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccl11P48298 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccl11P48298 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccl11P48298 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccl11P48298 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccl11P48298 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccl11P48298 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccl11P48298 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccl11P48298 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccl11P48298 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccl11P48298 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccl11P48298 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccl11P48298 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccl11P48298 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccl11P48298 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccl11P48298 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccl11P48298 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccl11P48298 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccl11P48298 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccl11P48298 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccl11P48298 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccl11P48298 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccl11P48298 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccl11P48298 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccl11P48298 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccl11P48298 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccl11P48298 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccl11P48298 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccl11P48298 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccl11P48298 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccl11P48298 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccl11P48298 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccl11P48298 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccl11P48298 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccl11P48298 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccl11P48298 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccl11P48298 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccl11P48298 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccl11P48298 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccl11P48298 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccl11P48298 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccl11P48298 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccl11P48298 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccl11P48298 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccl11P48298 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccl11P48298 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccl11P48298 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccl11P48298 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.9 ms