Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Epb41P48193 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Epb41P48193 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Epb41P48193 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Epb41P48193 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Epb41P48193 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Epb41P48193 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Epb41P48193 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Epb41P48193 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Epb41P48193 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Epb41P48193 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Epb41P48193 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Epb41P48193 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Epb41P48193 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Epb41P48193 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Epb41P48193 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
Epb41P48193 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Epb41P48193 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Epb41P48193 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Epb41P48193 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Epb41P48193 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Epb41P48193 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Epb41P48193 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Epb41P48193 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Epb41P48193 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Epb41P48193 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Epb41P48193 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Epb41P48193 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Epb41P48193 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Epb41P48193 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Epb41P48193 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Epb41P48193 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Epb41P48193 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Epb41P48193 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Epb41P48193 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Epb41P48193 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Epb41P48193 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Epb41P48193 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Epb41P48193 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Epb41P48193 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Epb41P48193 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Epb41P48193 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Epb41P48193 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Epb41P48193 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Epb41P48193 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Epb41P48193 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Epb41P48193 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Epb41P48193 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Epb41P48193 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Epb41P48193 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Epb41P48193 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Epb41P48193 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Epb41P48193 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Epb41P48193 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Epb41P48193 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Epb41P48193 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Epb41P48193 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Epb41P48193 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Epb41P48193 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Epb41P48193 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Epb41P48193 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Epb41P48193 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Epb41P48193 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Epb41P48193 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Epb41P48193 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Epb41P48193 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Epb41P48193 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Epb41P48193 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Epb41P48193 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Epb41P48193 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Epb41P48193 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Epb41P48193 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Epb41P48193 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Epb41P48193 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Epb41P48193 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Epb41P48193 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Epb41P48193 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Epb41P48193 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Epb41P48193 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Epb41P48193 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Epb41P48193 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Epb41P48193 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Epb41P48193 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Epb41P48193 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Epb41P48193 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Epb41P48193 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Epb41P48193 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Epb41P48193 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Epb41P48193 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Epb41P48193 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Epb41P48193 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Epb41P48193 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Epb41P48193 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Epb41P48193 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Epb41P48193 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Epb41P48193 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Epb41P48193 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Epb41P48193 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Epb41P48193 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Epb41P48193 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms