Protein–RNA interactions for Protein: P47963

Rpl13, 60S ribosomal protein L13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13P47963 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rpl13P47963 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rpl13P47963 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rpl13P47963 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rpl13P47963 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rpl13P47963 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Rpl13P47963 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rpl13P47963 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rpl13P47963 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rpl13P47963 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rpl13P47963 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rpl13P47963 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rpl13P47963 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rpl13P47963 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Rpl13P47963 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rpl13P47963 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rpl13P47963 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rpl13P47963 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rpl13P47963 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rpl13P47963 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rpl13P47963 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rpl13P47963 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rpl13P47963 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rpl13P47963 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rpl13P47963 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rpl13P47963 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Rpl13P47963 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rpl13P47963 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rpl13P47963 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rpl13P47963 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rpl13P47963 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rpl13P47963 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rpl13P47963 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rpl13P47963 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rpl13P47963 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rpl13P47963 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rpl13P47963 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rpl13P47963 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rpl13P47963 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rpl13P47963 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rpl13P47963 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Rpl13P47963 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rpl13P47963 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rpl13P47963 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rpl13P47963 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Rpl13P47963 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rpl13P47963 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rpl13P47963 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rpl13P47963 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rpl13P47963 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rpl13P47963 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rpl13P47963 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rpl13P47963 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rpl13P47963 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rpl13P47963 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rpl13P47963 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rpl13P47963 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rpl13P47963 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rpl13P47963 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rpl13P47963 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rpl13P47963 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rpl13P47963 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rpl13P47963 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rpl13P47963 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rpl13P47963 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Rpl13P47963 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rpl13P47963 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rpl13P47963 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rpl13P47963 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rpl13P47963 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rpl13P47963 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rpl13P47963 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rpl13P47963 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rpl13P47963 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rpl13P47963 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rpl13P47963 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rpl13P47963 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rpl13P47963 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rpl13P47963 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rpl13P47963 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rpl13P47963 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rpl13P47963 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rpl13P47963 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rpl13P47963 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rpl13P47963 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rpl13P47963 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rpl13P47963 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rpl13P47963 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rpl13P47963 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rpl13P47963 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rpl13P47963 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rpl13P47963 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rpl13P47963 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rpl13P47963 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rpl13P47963 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rpl13P47963 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rpl13P47963 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rpl13P47963 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rpl13P47963 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rpl13P47963 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms