Protein–RNA interactions for Protein: P47857

Pfkm, ATP-dependent 6-phosphofructokinase, muscle type, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PfkmP47857 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PfkmP47857 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PfkmP47857 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PfkmP47857 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PfkmP47857 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PfkmP47857 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PfkmP47857 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PfkmP47857 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PfkmP47857 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PfkmP47857 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PfkmP47857 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PfkmP47857 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PfkmP47857 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PfkmP47857 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PfkmP47857 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PfkmP47857 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PfkmP47857 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PfkmP47857 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PfkmP47857 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PfkmP47857 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PfkmP47857 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PfkmP47857 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PfkmP47857 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PfkmP47857 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PfkmP47857 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PfkmP47857 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PfkmP47857 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PfkmP47857 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PfkmP47857 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PfkmP47857 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PfkmP47857 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PfkmP47857 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PfkmP47857 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PfkmP47857 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PfkmP47857 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PfkmP47857 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PfkmP47857 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PfkmP47857 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PfkmP47857 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PfkmP47857 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PfkmP47857 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PfkmP47857 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PfkmP47857 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PfkmP47857 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PfkmP47857 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PfkmP47857 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PfkmP47857 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PfkmP47857 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PfkmP47857 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PfkmP47857 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PfkmP47857 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PfkmP47857 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PfkmP47857 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PfkmP47857 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PfkmP47857 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PfkmP47857 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PfkmP47857 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PfkmP47857 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PfkmP47857 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PfkmP47857 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PfkmP47857 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PfkmP47857 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PfkmP47857 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PfkmP47857 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PfkmP47857 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PfkmP47857 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PfkmP47857 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PfkmP47857 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PfkmP47857 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PfkmP47857 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PfkmP47857 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PfkmP47857 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PfkmP47857 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PfkmP47857 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PfkmP47857 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PfkmP47857 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PfkmP47857 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PfkmP47857 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PfkmP47857 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PfkmP47857 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PfkmP47857 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PfkmP47857 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PfkmP47857 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PfkmP47857 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PfkmP47857 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PfkmP47857 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PfkmP47857 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PfkmP47857 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PfkmP47857 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PfkmP47857 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PfkmP47857 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PfkmP47857 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PfkmP47857 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PfkmP47857 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PfkmP47857 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PfkmP47857 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PfkmP47857 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PfkmP47857 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PfkmP47857 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PfkmP47857 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms