Protein–RNA interactions for Protein: P47774

Ccr7, C-C chemokine receptor type 7, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr7P47774 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccr7P47774 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccr7P47774 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccr7P47774 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccr7P47774 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccr7P47774 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccr7P47774 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccr7P47774 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccr7P47774 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccr7P47774 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccr7P47774 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccr7P47774 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccr7P47774 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccr7P47774 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccr7P47774 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccr7P47774 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccr7P47774 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccr7P47774 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccr7P47774 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccr7P47774 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccr7P47774 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccr7P47774 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccr7P47774 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccr7P47774 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccr7P47774 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccr7P47774 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccr7P47774 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccr7P47774 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccr7P47774 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccr7P47774 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccr7P47774 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccr7P47774 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccr7P47774 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccr7P47774 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccr7P47774 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccr7P47774 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccr7P47774 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccr7P47774 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccr7P47774 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccr7P47774 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccr7P47774 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccr7P47774 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccr7P47774 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccr7P47774 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccr7P47774 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccr7P47774 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccr7P47774 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccr7P47774 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccr7P47774 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccr7P47774 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccr7P47774 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccr7P47774 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccr7P47774 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccr7P47774 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccr7P47774 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccr7P47774 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccr7P47774 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccr7P47774 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccr7P47774 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccr7P47774 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccr7P47774 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccr7P47774 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccr7P47774 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ccr7P47774 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccr7P47774 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccr7P47774 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccr7P47774 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccr7P47774 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccr7P47774 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccr7P47774 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccr7P47774 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccr7P47774 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccr7P47774 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccr7P47774 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccr7P47774 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccr7P47774 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccr7P47774 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccr7P47774 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccr7P47774 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccr7P47774 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccr7P47774 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccr7P47774 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccr7P47774 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccr7P47774 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccr7P47774 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccr7P47774 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccr7P47774 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccr7P47774 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccr7P47774 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccr7P47774 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccr7P47774 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccr7P47774 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccr7P47774 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccr7P47774 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccr7P47774 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccr7P47774 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccr7P47774 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccr7P47774 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccr7P47774 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccr7P47774 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms