Protein–RNA interactions for Protein: P46735

Myo1b, Unconventional myosin-Ib, mousemouse

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo1bP46735 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Myo1bP46735 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Myo1bP46735 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Myo1bP46735 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Myo1bP46735 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Myo1bP46735 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Myo1bP46735 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Myo1bP46735 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Myo1bP46735 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Myo1bP46735 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Myo1bP46735 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Myo1bP46735 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Myo1bP46735 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Myo1bP46735 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Myo1bP46735 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Myo1bP46735 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Myo1bP46735 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Myo1bP46735 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Myo1bP46735 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Myo1bP46735 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Myo1bP46735 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Myo1bP46735 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Myo1bP46735 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Myo1bP46735 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Myo1bP46735 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Myo1bP46735 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Myo1bP46735 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Myo1bP46735 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Myo1bP46735 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Myo1bP46735 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Myo1bP46735 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Myo1bP46735 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Myo1bP46735 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Myo1bP46735 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Myo1bP46735 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Myo1bP46735 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Myo1bP46735 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Myo1bP46735 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Myo1bP46735 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Myo1bP46735 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Myo1bP46735 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Myo1bP46735 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Myo1bP46735 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Myo1bP46735 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Myo1bP46735 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Myo1bP46735 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Myo1bP46735 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Myo1bP46735 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Myo1bP46735 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Myo1bP46735 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Myo1bP46735 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Myo1bP46735 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Myo1bP46735 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Myo1bP46735 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Myo1bP46735 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Myo1bP46735 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Myo1bP46735 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Myo1bP46735 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Myo1bP46735 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Myo1bP46735 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Myo1bP46735 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Myo1bP46735 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Myo1bP46735 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Myo1bP46735 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Myo1bP46735 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Myo1bP46735 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Myo1bP46735 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Myo1bP46735 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Myo1bP46735 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Myo1bP46735 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Myo1bP46735 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Myo1bP46735 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Myo1bP46735 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Myo1bP46735 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Myo1bP46735 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Myo1bP46735 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Myo1bP46735 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Myo1bP46735 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Myo1bP46735 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Myo1bP46735 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Myo1bP46735 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Myo1bP46735 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Myo1bP46735 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Myo1bP46735 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Myo1bP46735 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Myo1bP46735 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Myo1bP46735 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Myo1bP46735 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Myo1bP46735 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Myo1bP46735 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Myo1bP46735 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Myo1bP46735 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Myo1bP46735 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Myo1bP46735 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Myo1bP46735 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Myo1bP46735 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Myo1bP46735 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Myo1bP46735 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Myo1bP46735 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Myo1bP46735 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms