Protein–RNA interactions for Protein: P46684

Zic1, Zinc finger protein ZIC 1, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic1P46684 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zic1P46684 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zic1P46684 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zic1P46684 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zic1P46684 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zic1P46684 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zic1P46684 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zic1P46684 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zic1P46684 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zic1P46684 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zic1P46684 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zic1P46684 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zic1P46684 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Zic1P46684 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zic1P46684 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zic1P46684 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zic1P46684 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zic1P46684 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Zic1P46684 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zic1P46684 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Zic1P46684 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zic1P46684 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zic1P46684 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zic1P46684 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zic1P46684 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zic1P46684 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zic1P46684 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zic1P46684 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zic1P46684 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zic1P46684 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zic1P46684 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zic1P46684 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zic1P46684 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zic1P46684 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zic1P46684 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zic1P46684 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zic1P46684 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zic1P46684 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zic1P46684 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zic1P46684 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zic1P46684 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zic1P46684 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zic1P46684 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Zic1P46684 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zic1P46684 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zic1P46684 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zic1P46684 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zic1P46684 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zic1P46684 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zic1P46684 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zic1P46684 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zic1P46684 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zic1P46684 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zic1P46684 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zic1P46684 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zic1P46684 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zic1P46684 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zic1P46684 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zic1P46684 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zic1P46684 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zic1P46684 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zic1P46684 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zic1P46684 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zic1P46684 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zic1P46684 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zic1P46684 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zic1P46684 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zic1P46684 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zic1P46684 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Zic1P46684 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zic1P46684 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zic1P46684 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zic1P46684 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zic1P46684 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zic1P46684 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zic1P46684 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Zic1P46684 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zic1P46684 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zic1P46684 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zic1P46684 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Zic1P46684 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zic1P46684 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zic1P46684 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zic1P46684 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zic1P46684 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zic1P46684 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zic1P46684 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zic1P46684 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zic1P46684 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zic1P46684 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zic1P46684 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zic1P46684 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zic1P46684 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zic1P46684 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zic1P46684 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Zic1P46684 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zic1P46684 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zic1P46684 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zic1P46684 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Zic1P46684 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms