Protein–RNA interactions for Protein: P43137

Reg1, Lithostathine-1, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reg1P43137 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Reg1P43137 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Reg1P43137 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Reg1P43137 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Reg1P43137 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Reg1P43137 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Reg1P43137 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Reg1P43137 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Reg1P43137 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Reg1P43137 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Reg1P43137 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Reg1P43137 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Reg1P43137 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Reg1P43137 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Reg1P43137 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Reg1P43137 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Reg1P43137 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Reg1P43137 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Reg1P43137 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Reg1P43137 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Reg1P43137 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Reg1P43137 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Reg1P43137 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Reg1P43137 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Reg1P43137 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Reg1P43137 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Reg1P43137 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Reg1P43137 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Reg1P43137 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Reg1P43137 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Reg1P43137 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Reg1P43137 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Reg1P43137 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Reg1P43137 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Reg1P43137 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Reg1P43137 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Reg1P43137 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Reg1P43137 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Reg1P43137 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Reg1P43137 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Reg1P43137 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Reg1P43137 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Reg1P43137 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Reg1P43137 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Reg1P43137 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Reg1P43137 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Reg1P43137 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Reg1P43137 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Reg1P43137 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Reg1P43137 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Reg1P43137 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Reg1P43137 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Reg1P43137 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Reg1P43137 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Reg1P43137 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Reg1P43137 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Reg1P43137 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Reg1P43137 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Reg1P43137 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Reg1P43137 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Reg1P43137 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Reg1P43137 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Reg1P43137 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Reg1P43137 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Reg1P43137 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Reg1P43137 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Reg1P43137 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Reg1P43137 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Reg1P43137 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Reg1P43137 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Reg1P43137 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Reg1P43137 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Reg1P43137 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Reg1P43137 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Reg1P43137 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Reg1P43137 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Reg1P43137 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Reg1P43137 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Reg1P43137 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Reg1P43137 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Reg1P43137 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Reg1P43137 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Reg1P43137 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Reg1P43137 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Reg1P43137 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Reg1P43137 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Reg1P43137 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Reg1P43137 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Reg1P43137 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Reg1P43137 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Reg1P43137 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Reg1P43137 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Reg1P43137 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Reg1P43137 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Reg1P43137 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Reg1P43137 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Reg1P43137 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Reg1P43137 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Reg1P43137 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Reg1P43137 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.3 ms