Protein–RNA interactions for Protein: P41969

Elk1, ETS domain-containing protein Elk-1, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elk1P41969 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Elk1P41969 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Elk1P41969 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Elk1P41969 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Elk1P41969 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Elk1P41969 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Elk1P41969 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Elk1P41969 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Elk1P41969 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Elk1P41969 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Elk1P41969 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Elk1P41969 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Elk1P41969 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Elk1P41969 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Elk1P41969 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Elk1P41969 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Elk1P41969 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Elk1P41969 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Elk1P41969 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Elk1P41969 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Elk1P41969 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Elk1P41969 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Elk1P41969 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Elk1P41969 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Elk1P41969 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Elk1P41969 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Elk1P41969 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Elk1P41969 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Elk1P41969 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Elk1P41969 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Elk1P41969 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Elk1P41969 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Elk1P41969 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Elk1P41969 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Elk1P41969 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Elk1P41969 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Elk1P41969 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Elk1P41969 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Elk1P41969 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Elk1P41969 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Elk1P41969 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Elk1P41969 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Elk1P41969 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Elk1P41969 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Elk1P41969 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Elk1P41969 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Elk1P41969 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Elk1P41969 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Elk1P41969 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Elk1P41969 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Elk1P41969 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Elk1P41969 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Elk1P41969 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Elk1P41969 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Elk1P41969 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Elk1P41969 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Elk1P41969 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Elk1P41969 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Elk1P41969 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Elk1P41969 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Elk1P41969 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Elk1P41969 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Elk1P41969 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Elk1P41969 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Elk1P41969 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Elk1P41969 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Elk1P41969 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Elk1P41969 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Elk1P41969 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Elk1P41969 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Elk1P41969 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Elk1P41969 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Elk1P41969 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Elk1P41969 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Elk1P41969 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Elk1P41969 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Elk1P41969 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Elk1P41969 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Elk1P41969 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Elk1P41969 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Elk1P41969 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Elk1P41969 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Elk1P41969 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Elk1P41969 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Elk1P41969 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Elk1P41969 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Elk1P41969 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Elk1P41969 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Elk1P41969 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Elk1P41969 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Elk1P41969 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Elk1P41969 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Elk1P41969 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Elk1P41969 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Elk1P41969 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Elk1P41969 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Elk1P41969 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Elk1P41969 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Elk1P41969 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Elk1P41969 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 160.1 ms