Protein–RNA interactions for Protein: P40336

Vps26a, Vacuolar protein sorting-associated protein 26A, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps26aP40336 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps26aP40336 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps26aP40336 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps26aP40336 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps26aP40336 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Vps26aP40336 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vps26aP40336 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vps26aP40336 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vps26aP40336 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Vps26aP40336 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vps26aP40336 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vps26aP40336 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vps26aP40336 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vps26aP40336 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vps26aP40336 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vps26aP40336 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vps26aP40336 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps26aP40336 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps26aP40336 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps26aP40336 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps26aP40336 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vps26aP40336 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vps26aP40336 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vps26aP40336 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vps26aP40336 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Vps26aP40336 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Vps26aP40336 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Vps26aP40336 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Vps26aP40336 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vps26aP40336 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vps26aP40336 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vps26aP40336 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps26aP40336 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps26aP40336 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps26aP40336 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps26aP40336 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps26aP40336 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps26aP40336 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps26aP40336 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps26aP40336 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps26aP40336 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps26aP40336 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps26aP40336 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps26aP40336 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps26aP40336 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps26aP40336 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps26aP40336 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps26aP40336 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps26aP40336 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps26aP40336 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps26aP40336 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vps26aP40336 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Vps26aP40336 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vps26aP40336 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vps26aP40336 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vps26aP40336 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Vps26aP40336 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vps26aP40336 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps26aP40336 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps26aP40336 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps26aP40336 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps26aP40336 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps26aP40336 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps26aP40336 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps26aP40336 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps26aP40336 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vps26aP40336 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vps26aP40336 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vps26aP40336 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vps26aP40336 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vps26aP40336 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vps26aP40336 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Vps26aP40336 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vps26aP40336 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vps26aP40336 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vps26aP40336 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vps26aP40336 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vps26aP40336 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vps26aP40336 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vps26aP40336 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vps26aP40336 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vps26aP40336 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vps26aP40336 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vps26aP40336 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vps26aP40336 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vps26aP40336 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vps26aP40336 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vps26aP40336 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vps26aP40336 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Vps26aP40336 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vps26aP40336 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Vps26aP40336 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vps26aP40336 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vps26aP40336 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vps26aP40336 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vps26aP40336 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vps26aP40336 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vps26aP40336 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vps26aP40336 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vps26aP40336 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms