Protein–RNA interactions for Protein: P40240

Cd9, CD9 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd9P40240 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd9P40240 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd9P40240 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd9P40240 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd9P40240 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd9P40240 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd9P40240 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd9P40240 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd9P40240 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd9P40240 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd9P40240 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd9P40240 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd9P40240 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd9P40240 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd9P40240 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd9P40240 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd9P40240 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd9P40240 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cd9P40240 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cd9P40240 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cd9P40240 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cd9P40240 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cd9P40240 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cd9P40240 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cd9P40240 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd9P40240 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd9P40240 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd9P40240 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd9P40240 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd9P40240 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd9P40240 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd9P40240 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd9P40240 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd9P40240 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd9P40240 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd9P40240 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd9P40240 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd9P40240 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cd9P40240 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cd9P40240 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cd9P40240 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cd9P40240 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cd9P40240 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd9P40240 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd9P40240 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd9P40240 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd9P40240 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd9P40240 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd9P40240 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd9P40240 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd9P40240 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd9P40240 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd9P40240 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd9P40240 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd9P40240 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd9P40240 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cd9P40240 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cd9P40240 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cd9P40240 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cd9P40240 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cd9P40240 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd9P40240 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd9P40240 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd9P40240 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd9P40240 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd9P40240 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd9P40240 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd9P40240 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd9P40240 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd9P40240 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd9P40240 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd9P40240 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd9P40240 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd9P40240 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd9P40240 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd9P40240 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd9P40240 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd9P40240 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd9P40240 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd9P40240 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd9P40240 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd9P40240 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd9P40240 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd9P40240 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd9P40240 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd9P40240 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd9P40240 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd9P40240 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd9P40240 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd9P40240 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd9P40240 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd9P40240 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd9P40240 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd9P40240 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd9P40240 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd9P40240 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd9P40240 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd9P40240 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cd9P40240 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd9P40240 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms