Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ThpoP40226 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ThpoP40226 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ThpoP40226 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ThpoP40226 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ThpoP40226 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ThpoP40226 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ThpoP40226 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ThpoP40226 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ThpoP40226 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ThpoP40226 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
ThpoP40226 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ThpoP40226 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
ThpoP40226 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ThpoP40226 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ThpoP40226 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ThpoP40226 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ThpoP40226 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ThpoP40226 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ThpoP40226 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ThpoP40226 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ThpoP40226 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ThpoP40226 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ThpoP40226 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ThpoP40226 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ThpoP40226 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ThpoP40226 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ThpoP40226 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ThpoP40226 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ThpoP40226 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ThpoP40226 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ThpoP40226 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ThpoP40226 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ThpoP40226 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ThpoP40226 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ThpoP40226 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ThpoP40226 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ThpoP40226 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ThpoP40226 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ThpoP40226 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ThpoP40226 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ThpoP40226 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
ThpoP40226 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
ThpoP40226 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ThpoP40226 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ThpoP40226 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ThpoP40226 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ThpoP40226 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ThpoP40226 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ThpoP40226 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ThpoP40226 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ThpoP40226 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ThpoP40226 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ThpoP40226 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ThpoP40226 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ThpoP40226 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ThpoP40226 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ThpoP40226 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ThpoP40226 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ThpoP40226 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ThpoP40226 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ThpoP40226 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ThpoP40226 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ThpoP40226 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ThpoP40226 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ThpoP40226 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ThpoP40226 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ThpoP40226 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ThpoP40226 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ThpoP40226 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ThpoP40226 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ThpoP40226 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ThpoP40226 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ThpoP40226 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ThpoP40226 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ThpoP40226 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ThpoP40226 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ThpoP40226 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ThpoP40226 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ThpoP40226 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ThpoP40226 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ThpoP40226 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ThpoP40226 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ThpoP40226 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ThpoP40226 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ThpoP40226 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ThpoP40226 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ThpoP40226 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ThpoP40226 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ThpoP40226 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ThpoP40226 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ThpoP40226 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ThpoP40226 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ThpoP40226 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ThpoP40226 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ThpoP40226 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ThpoP40226 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ThpoP40226 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ThpoP40226 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ThpoP40226 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.2 ms