Protein–RNA interactions for Protein: P35459

Ly6d, Lymphocyte antigen 6D, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6dP35459 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ly6dP35459 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ly6dP35459 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ly6dP35459 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ly6dP35459 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ly6dP35459 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ly6dP35459 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ly6dP35459 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ly6dP35459 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ly6dP35459 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Ly6dP35459 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ly6dP35459 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ly6dP35459 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ly6dP35459 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ly6dP35459 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ly6dP35459 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ly6dP35459 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ly6dP35459 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ly6dP35459 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Ly6dP35459 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ly6dP35459 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ly6dP35459 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ly6dP35459 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ly6dP35459 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ly6dP35459 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Ly6dP35459 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ly6dP35459 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ly6dP35459 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ly6dP35459 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ly6dP35459 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ly6dP35459 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ly6dP35459 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ly6dP35459 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ly6dP35459 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Ly6dP35459 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ly6dP35459 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ly6dP35459 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ly6dP35459 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ly6dP35459 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ly6dP35459 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ly6dP35459 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ly6dP35459 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ly6dP35459 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ly6dP35459 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ly6dP35459 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ly6dP35459 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ly6dP35459 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Ly6dP35459 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ly6dP35459 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ly6dP35459 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ly6dP35459 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ly6dP35459 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ly6dP35459 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ly6dP35459 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ly6dP35459 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ly6dP35459 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Ly6dP35459 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ly6dP35459 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ly6dP35459 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ly6dP35459 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ly6dP35459 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ly6dP35459 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ly6dP35459 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ly6dP35459 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ly6dP35459 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ly6dP35459 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ly6dP35459 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Ly6dP35459 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ly6dP35459 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ly6dP35459 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ly6dP35459 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ly6dP35459 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ly6dP35459 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ly6dP35459 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ly6dP35459 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ly6dP35459 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ly6dP35459 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ly6dP35459 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ly6dP35459 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ly6dP35459 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Ly6dP35459 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ly6dP35459 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ly6dP35459 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ly6dP35459 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ly6dP35459 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ly6dP35459 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ly6dP35459 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ly6dP35459 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ly6dP35459 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ly6dP35459 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ly6dP35459 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ly6dP35459 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ly6dP35459 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ly6dP35459 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ly6dP35459 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ly6dP35459 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ly6dP35459 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ly6dP35459 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ly6dP35459 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ly6dP35459 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms