Protein–RNA interactions for Protein: P31361

Pou3f3, POU domain, class 3, transcription factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f3P31361 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pou3f3P31361 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pou3f3P31361 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pou3f3P31361 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pou3f3P31361 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pou3f3P31361 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pou3f3P31361 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pou3f3P31361 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pou3f3P31361 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pou3f3P31361 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pou3f3P31361 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pou3f3P31361 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pou3f3P31361 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pou3f3P31361 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pou3f3P31361 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pou3f3P31361 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Pou3f3P31361 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pou3f3P31361 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pou3f3P31361 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pou3f3P31361 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pou3f3P31361 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pou3f3P31361 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pou3f3P31361 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pou3f3P31361 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pou3f3P31361 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Pou3f3P31361 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pou3f3P31361 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pou3f3P31361 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pou3f3P31361 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pou3f3P31361 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pou3f3P31361 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pou3f3P31361 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pou3f3P31361 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pou3f3P31361 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pou3f3P31361 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pou3f3P31361 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pou3f3P31361 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pou3f3P31361 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pou3f3P31361 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pou3f3P31361 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pou3f3P31361 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pou3f3P31361 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Pou3f3P31361 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pou3f3P31361 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pou3f3P31361 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pou3f3P31361 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pou3f3P31361 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pou3f3P31361 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Pou3f3P31361 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pou3f3P31361 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pou3f3P31361 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pou3f3P31361 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pou3f3P31361 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pou3f3P31361 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pou3f3P31361 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pou3f3P31361 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pou3f3P31361 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pou3f3P31361 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pou3f3P31361 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pou3f3P31361 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pou3f3P31361 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pou3f3P31361 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pou3f3P31361 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pou3f3P31361 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Pou3f3P31361 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pou3f3P31361 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pou3f3P31361 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pou3f3P31361 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pou3f3P31361 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pou3f3P31361 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pou3f3P31361 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pou3f3P31361 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pou3f3P31361 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pou3f3P31361 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pou3f3P31361 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Pou3f3P31361 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pou3f3P31361 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pou3f3P31361 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pou3f3P31361 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pou3f3P31361 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pou3f3P31361 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pou3f3P31361 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pou3f3P31361 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pou3f3P31361 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pou3f3P31361 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pou3f3P31361 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pou3f3P31361 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pou3f3P31361 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pou3f3P31361 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Pou3f3P31361 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pou3f3P31361 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Pou3f3P31361 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pou3f3P31361 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pou3f3P31361 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pou3f3P31361 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pou3f3P31361 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Pou3f3P31361 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pou3f3P31361 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pou3f3P31361 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pou3f3P31361 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.2 ms