Protein–RNA interactions for Protein: P30548

Tacr1, Substance-P receptor, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tacr1P30548 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tacr1P30548 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tacr1P30548 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tacr1P30548 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tacr1P30548 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tacr1P30548 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tacr1P30548 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tacr1P30548 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tacr1P30548 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Tacr1P30548 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tacr1P30548 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Tacr1P30548 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tacr1P30548 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tacr1P30548 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tacr1P30548 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tacr1P30548 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Tacr1P30548 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tacr1P30548 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tacr1P30548 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tacr1P30548 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tacr1P30548 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tacr1P30548 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tacr1P30548 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tacr1P30548 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Tacr1P30548 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tacr1P30548 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tacr1P30548 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tacr1P30548 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tacr1P30548 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tacr1P30548 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tacr1P30548 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tacr1P30548 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tacr1P30548 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tacr1P30548 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tacr1P30548 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tacr1P30548 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tacr1P30548 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tacr1P30548 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tacr1P30548 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tacr1P30548 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tacr1P30548 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tacr1P30548 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tacr1P30548 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tacr1P30548 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tacr1P30548 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tacr1P30548 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Tacr1P30548 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tacr1P30548 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tacr1P30548 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tacr1P30548 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tacr1P30548 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tacr1P30548 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tacr1P30548 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tacr1P30548 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tacr1P30548 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tacr1P30548 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tacr1P30548 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tacr1P30548 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tacr1P30548 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tacr1P30548 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tacr1P30548 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tacr1P30548 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tacr1P30548 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tacr1P30548 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Tacr1P30548 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tacr1P30548 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tacr1P30548 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tacr1P30548 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tacr1P30548 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tacr1P30548 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tacr1P30548 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tacr1P30548 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tacr1P30548 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tacr1P30548 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tacr1P30548 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tacr1P30548 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tacr1P30548 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tacr1P30548 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Tacr1P30548 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tacr1P30548 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Tacr1P30548 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tacr1P30548 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tacr1P30548 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tacr1P30548 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tacr1P30548 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tacr1P30548 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tacr1P30548 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tacr1P30548 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tacr1P30548 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tacr1P30548 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tacr1P30548 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tacr1P30548 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Tacr1P30548 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tacr1P30548 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tacr1P30548 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tacr1P30548 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tacr1P30548 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tacr1P30548 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tacr1P30548 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tacr1P30548 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms