Protein–RNA interactions for Protein: P28575

Ipp, Actin-binding protein IPP, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IppP28575 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IppP28575 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IppP28575 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
IppP28575 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
IppP28575 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IppP28575 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IppP28575 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
IppP28575 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IppP28575 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IppP28575 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IppP28575 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IppP28575 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IppP28575 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IppP28575 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IppP28575 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IppP28575 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IppP28575 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IppP28575 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IppP28575 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IppP28575 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IppP28575 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IppP28575 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IppP28575 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IppP28575 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IppP28575 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IppP28575 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IppP28575 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
IppP28575 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IppP28575 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IppP28575 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IppP28575 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IppP28575 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IppP28575 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IppP28575 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IppP28575 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IppP28575 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IppP28575 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IppP28575 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IppP28575 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
IppP28575 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IppP28575 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IppP28575 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IppP28575 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IppP28575 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IppP28575 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IppP28575 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IppP28575 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IppP28575 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IppP28575 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IppP28575 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IppP28575 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IppP28575 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IppP28575 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IppP28575 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IppP28575 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IppP28575 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IppP28575 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IppP28575 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IppP28575 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IppP28575 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IppP28575 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IppP28575 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
IppP28575 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
IppP28575 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IppP28575 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IppP28575 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IppP28575 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
IppP28575 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
IppP28575 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
IppP28575 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IppP28575 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IppP28575 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IppP28575 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IppP28575 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IppP28575 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IppP28575 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IppP28575 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IppP28575 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IppP28575 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IppP28575 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IppP28575 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IppP28575 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IppP28575 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
IppP28575 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IppP28575 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IppP28575 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
IppP28575 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IppP28575 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IppP28575 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IppP28575 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IppP28575 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IppP28575 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IppP28575 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IppP28575 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IppP28575 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IppP28575 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IppP28575 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IppP28575 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IppP28575 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IppP28575 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms