Protein–RNA interactions for Protein: P26011

Itgb7, Integrin beta-7, mousemouse

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb7P26011 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Itgb7P26011 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Itgb7P26011 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Itgb7P26011 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Itgb7P26011 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Itgb7P26011 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Itgb7P26011 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Itgb7P26011 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Itgb7P26011 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Itgb7P26011 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Itgb7P26011 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Itgb7P26011 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Itgb7P26011 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Itgb7P26011 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Itgb7P26011 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Itgb7P26011 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Itgb7P26011 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Itgb7P26011 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Itgb7P26011 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Itgb7P26011 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Itgb7P26011 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Itgb7P26011 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Itgb7P26011 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Itgb7P26011 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Itgb7P26011 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Itgb7P26011 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Itgb7P26011 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Itgb7P26011 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Itgb7P26011 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Itgb7P26011 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Itgb7P26011 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Itgb7P26011 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Itgb7P26011 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Itgb7P26011 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Itgb7P26011 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Itgb7P26011 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Itgb7P26011 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Itgb7P26011 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Itgb7P26011 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Itgb7P26011 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Itgb7P26011 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Itgb7P26011 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Itgb7P26011 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Itgb7P26011 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Itgb7P26011 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Itgb7P26011 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Itgb7P26011 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Itgb7P26011 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Itgb7P26011 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Itgb7P26011 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Itgb7P26011 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Itgb7P26011 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Itgb7P26011 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Itgb7P26011 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Itgb7P26011 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Itgb7P26011 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Itgb7P26011 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Itgb7P26011 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Itgb7P26011 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Itgb7P26011 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Itgb7P26011 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Itgb7P26011 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Itgb7P26011 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Itgb7P26011 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Itgb7P26011 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Itgb7P26011 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Itgb7P26011 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Itgb7P26011 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Itgb7P26011 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Itgb7P26011 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Itgb7P26011 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Itgb7P26011 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Itgb7P26011 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Itgb7P26011 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Itgb7P26011 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Itgb7P26011 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Itgb7P26011 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Itgb7P26011 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Itgb7P26011 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Itgb7P26011 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Itgb7P26011 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Itgb7P26011 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Itgb7P26011 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Itgb7P26011 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Itgb7P26011 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Itgb7P26011 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Itgb7P26011 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Itgb7P26011 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Itgb7P26011 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Itgb7P26011 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Itgb7P26011 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Itgb7P26011 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Itgb7P26011 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Itgb7P26011 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Itgb7P26011 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Itgb7P26011 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Itgb7P26011 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Itgb7P26011 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Itgb7P26011 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Itgb7P26011 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms