Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NdnP25233 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NdnP25233 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NdnP25233 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NdnP25233 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NdnP25233 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NdnP25233 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NdnP25233 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NdnP25233 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NdnP25233 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NdnP25233 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NdnP25233 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NdnP25233 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NdnP25233 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NdnP25233 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NdnP25233 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NdnP25233 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NdnP25233 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NdnP25233 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NdnP25233 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NdnP25233 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NdnP25233 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NdnP25233 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NdnP25233 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NdnP25233 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NdnP25233 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NdnP25233 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NdnP25233 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NdnP25233 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NdnP25233 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NdnP25233 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NdnP25233 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NdnP25233 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NdnP25233 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NdnP25233 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NdnP25233 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NdnP25233 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NdnP25233 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NdnP25233 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NdnP25233 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NdnP25233 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NdnP25233 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NdnP25233 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NdnP25233 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NdnP25233 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NdnP25233 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NdnP25233 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NdnP25233 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NdnP25233 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NdnP25233 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NdnP25233 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NdnP25233 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NdnP25233 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NdnP25233 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NdnP25233 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NdnP25233 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NdnP25233 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NdnP25233 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NdnP25233 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NdnP25233 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NdnP25233 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NdnP25233 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NdnP25233 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NdnP25233 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NdnP25233 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NdnP25233 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NdnP25233 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NdnP25233 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NdnP25233 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NdnP25233 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NdnP25233 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NdnP25233 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NdnP25233 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NdnP25233 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NdnP25233 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NdnP25233 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NdnP25233 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NdnP25233 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NdnP25233 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NdnP25233 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NdnP25233 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NdnP25233 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NdnP25233 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NdnP25233 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NdnP25233 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NdnP25233 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NdnP25233 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NdnP25233 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NdnP25233 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NdnP25233 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NdnP25233 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NdnP25233 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NdnP25233 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NdnP25233 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NdnP25233 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NdnP25233 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NdnP25233 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NdnP25233 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NdnP25233 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NdnP25233 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.9 ms