Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxd12P23812 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxd12P23812 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxd12P23812 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxd12P23812 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxd12P23812 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxd12P23812 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxd12P23812 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxd12P23812 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxd12P23812 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxd12P23812 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxd12P23812 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxd12P23812 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxd12P23812 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxd12P23812 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxd12P23812 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxd12P23812 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxd12P23812 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxd12P23812 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxd12P23812 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxd12P23812 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxd12P23812 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxd12P23812 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxd12P23812 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxd12P23812 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxd12P23812 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxd12P23812 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxd12P23812 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxd12P23812 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxd12P23812 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxd12P23812 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxd12P23812 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hoxd12P23812 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hoxd12P23812 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxd12P23812 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxd12P23812 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxd12P23812 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hoxd12P23812 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hoxd12P23812 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hoxd12P23812 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hoxd12P23812 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxd12P23812 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxd12P23812 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxd12P23812 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxd12P23812 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxd12P23812 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxd12P23812 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxd12P23812 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxd12P23812 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxd12P23812 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxd12P23812 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxd12P23812 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxd12P23812 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxd12P23812 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxd12P23812 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxd12P23812 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxd12P23812 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxd12P23812 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxd12P23812 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxd12P23812 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxd12P23812 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxd12P23812 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Hoxd12P23812 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hoxd12P23812 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hoxd12P23812 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hoxd12P23812 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hoxd12P23812 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxd12P23812 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxd12P23812 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxd12P23812 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxd12P23812 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxd12P23812 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxd12P23812 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxd12P23812 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxd12P23812 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxd12P23812 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxd12P23812 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxd12P23812 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxd12P23812 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxd12P23812 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxd12P23812 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxd12P23812 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxd12P23812 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxd12P23812 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxd12P23812 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hoxd12P23812 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hoxd12P23812 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hoxd12P23812 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxd12P23812 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxd12P23812 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxd12P23812 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxd12P23812 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxd12P23812 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxd12P23812 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxd12P23812 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxd12P23812 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxd12P23812 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxd12P23812 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxd12P23812 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxd12P23812 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms