Protein–RNA interactions for Protein: P23591

Tsta3, GDP-L-fucose synthase, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsta3P23591 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tsta3P23591 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tsta3P23591 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tsta3P23591 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tsta3P23591 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tsta3P23591 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tsta3P23591 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tsta3P23591 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tsta3P23591 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tsta3P23591 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tsta3P23591 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tsta3P23591 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tsta3P23591 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Tsta3P23591 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Tsta3P23591 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tsta3P23591 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tsta3P23591 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tsta3P23591 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tsta3P23591 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tsta3P23591 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Tsta3P23591 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Tsta3P23591 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tsta3P23591 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tsta3P23591 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tsta3P23591 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tsta3P23591 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tsta3P23591 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tsta3P23591 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tsta3P23591 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tsta3P23591 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tsta3P23591 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tsta3P23591 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tsta3P23591 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tsta3P23591 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Tsta3P23591 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tsta3P23591 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tsta3P23591 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tsta3P23591 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Tsta3P23591 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tsta3P23591 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tsta3P23591 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tsta3P23591 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tsta3P23591 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tsta3P23591 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tsta3P23591 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tsta3P23591 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Tsta3P23591 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tsta3P23591 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tsta3P23591 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tsta3P23591 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tsta3P23591 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tsta3P23591 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tsta3P23591 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tsta3P23591 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tsta3P23591 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tsta3P23591 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tsta3P23591 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tsta3P23591 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tsta3P23591 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tsta3P23591 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tsta3P23591 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tsta3P23591 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Tsta3P23591 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tsta3P23591 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tsta3P23591 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tsta3P23591 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tsta3P23591 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tsta3P23591 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tsta3P23591 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Tsta3P23591 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tsta3P23591 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tsta3P23591 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tsta3P23591 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tsta3P23591 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tsta3P23591 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tsta3P23591 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Tsta3P23591 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tsta3P23591 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tsta3P23591 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tsta3P23591 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tsta3P23591 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tsta3P23591 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tsta3P23591 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tsta3P23591 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tsta3P23591 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tsta3P23591 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tsta3P23591 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tsta3P23591 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tsta3P23591 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tsta3P23591 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tsta3P23591 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tsta3P23591 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tsta3P23591 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tsta3P23591 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tsta3P23591 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tsta3P23591 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tsta3P23591 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Tsta3P23591 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tsta3P23591 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tsta3P23591 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.7 ms