Protein–RNA interactions for Protein: P19437

Ms4a1, B-lymphocyte antigen CD20, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a1P19437 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ms4a1P19437 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ms4a1P19437 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ms4a1P19437 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ms4a1P19437 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ms4a1P19437 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ms4a1P19437 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ms4a1P19437 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ms4a1P19437 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ms4a1P19437 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ms4a1P19437 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ms4a1P19437 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ms4a1P19437 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ms4a1P19437 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ms4a1P19437 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ms4a1P19437 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ms4a1P19437 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ms4a1P19437 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ms4a1P19437 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ms4a1P19437 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ms4a1P19437 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ms4a1P19437 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ms4a1P19437 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ms4a1P19437 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ms4a1P19437 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ms4a1P19437 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ms4a1P19437 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ms4a1P19437 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ms4a1P19437 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ms4a1P19437 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ms4a1P19437 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ms4a1P19437 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ms4a1P19437 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ms4a1P19437 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ms4a1P19437 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ms4a1P19437 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ms4a1P19437 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ms4a1P19437 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ms4a1P19437 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ms4a1P19437 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ms4a1P19437 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ms4a1P19437 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ms4a1P19437 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ms4a1P19437 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ms4a1P19437 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ms4a1P19437 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ms4a1P19437 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ms4a1P19437 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ms4a1P19437 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ms4a1P19437 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ms4a1P19437 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ms4a1P19437 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ms4a1P19437 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ms4a1P19437 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ms4a1P19437 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ms4a1P19437 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ms4a1P19437 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ms4a1P19437 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ms4a1P19437 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ms4a1P19437 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ms4a1P19437 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ms4a1P19437 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ms4a1P19437 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ms4a1P19437 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ms4a1P19437 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ms4a1P19437 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ms4a1P19437 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ms4a1P19437 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ms4a1P19437 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ms4a1P19437 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ms4a1P19437 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ms4a1P19437 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ms4a1P19437 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ms4a1P19437 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ms4a1P19437 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ms4a1P19437 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ms4a1P19437 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ms4a1P19437 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ms4a1P19437 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ms4a1P19437 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ms4a1P19437 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ms4a1P19437 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ms4a1P19437 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ms4a1P19437 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ms4a1P19437 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ms4a1P19437 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ms4a1P19437 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ms4a1P19437 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ms4a1P19437 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ms4a1P19437 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ms4a1P19437 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ms4a1P19437 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ms4a1P19437 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ms4a1P19437 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ms4a1P19437 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ms4a1P19437 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ms4a1P19437 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ms4a1P19437 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ms4a1P19437 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ms4a1P19437 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms