Protein–RNA interactions for Protein: P19182

Ifrd1, Interferon-related developmental regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd1P19182 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ifrd1P19182 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ifrd1P19182 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ifrd1P19182 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ifrd1P19182 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ifrd1P19182 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ifrd1P19182 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ifrd1P19182 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ifrd1P19182 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ifrd1P19182 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ifrd1P19182 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ifrd1P19182 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ifrd1P19182 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ifrd1P19182 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ifrd1P19182 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ifrd1P19182 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ifrd1P19182 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ifrd1P19182 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ifrd1P19182 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ifrd1P19182 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ifrd1P19182 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ifrd1P19182 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ifrd1P19182 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ifrd1P19182 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ifrd1P19182 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ifrd1P19182 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ifrd1P19182 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ifrd1P19182 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ifrd1P19182 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ifrd1P19182 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ifrd1P19182 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ifrd1P19182 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ifrd1P19182 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ifrd1P19182 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ifrd1P19182 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ifrd1P19182 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ifrd1P19182 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ifrd1P19182 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ifrd1P19182 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ifrd1P19182 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ifrd1P19182 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ifrd1P19182 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ifrd1P19182 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ifrd1P19182 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ifrd1P19182 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ifrd1P19182 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ifrd1P19182 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ifrd1P19182 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ifrd1P19182 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ifrd1P19182 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ifrd1P19182 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ifrd1P19182 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ifrd1P19182 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ifrd1P19182 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ifrd1P19182 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ifrd1P19182 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ifrd1P19182 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ifrd1P19182 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ifrd1P19182 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ifrd1P19182 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ifrd1P19182 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ifrd1P19182 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ifrd1P19182 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ifrd1P19182 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ifrd1P19182 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ifrd1P19182 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ifrd1P19182 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ifrd1P19182 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ifrd1P19182 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ifrd1P19182 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ifrd1P19182 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ifrd1P19182 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ifrd1P19182 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ifrd1P19182 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ifrd1P19182 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ifrd1P19182 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ifrd1P19182 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ifrd1P19182 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ifrd1P19182 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ifrd1P19182 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ifrd1P19182 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ifrd1P19182 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ifrd1P19182 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ifrd1P19182 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ifrd1P19182 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ifrd1P19182 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ifrd1P19182 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ifrd1P19182 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ifrd1P19182 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ifrd1P19182 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ifrd1P19182 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ifrd1P19182 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ifrd1P19182 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ifrd1P19182 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ifrd1P19182 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ifrd1P19182 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ifrd1P19182 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ifrd1P19182 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ifrd1P19182 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ifrd1P19182 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms