Protein–RNA interactions for Protein: P18340

Cxcl9, C-X-C motif chemokine 9, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl9P18340 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cxcl9P18340 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cxcl9P18340 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cxcl9P18340 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cxcl9P18340 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cxcl9P18340 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cxcl9P18340 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cxcl9P18340 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cxcl9P18340 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cxcl9P18340 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Cxcl9P18340 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Cxcl9P18340 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cxcl9P18340 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cxcl9P18340 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Cxcl9P18340 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cxcl9P18340 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cxcl9P18340 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Cxcl9P18340 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Cxcl9P18340 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cxcl9P18340 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Cxcl9P18340 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cxcl9P18340 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cxcl9P18340 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cxcl9P18340 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cxcl9P18340 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cxcl9P18340 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cxcl9P18340 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cxcl9P18340 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cxcl9P18340 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cxcl9P18340 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Cxcl9P18340 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cxcl9P18340 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cxcl9P18340 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cxcl9P18340 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cxcl9P18340 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cxcl9P18340 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Cxcl9P18340 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cxcl9P18340 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cxcl9P18340 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cxcl9P18340 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cxcl9P18340 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cxcl9P18340 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cxcl9P18340 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cxcl9P18340 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cxcl9P18340 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cxcl9P18340 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cxcl9P18340 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cxcl9P18340 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cxcl9P18340 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cxcl9P18340 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cxcl9P18340 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cxcl9P18340 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cxcl9P18340 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Cxcl9P18340 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Cxcl9P18340 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cxcl9P18340 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cxcl9P18340 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Cxcl9P18340 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cxcl9P18340 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cxcl9P18340 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cxcl9P18340 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cxcl9P18340 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cxcl9P18340 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cxcl9P18340 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cxcl9P18340 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cxcl9P18340 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cxcl9P18340 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cxcl9P18340 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cxcl9P18340 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cxcl9P18340 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cxcl9P18340 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cxcl9P18340 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cxcl9P18340 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cxcl9P18340 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cxcl9P18340 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cxcl9P18340 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cxcl9P18340 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Cxcl9P18340 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cxcl9P18340 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cxcl9P18340 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cxcl9P18340 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Cxcl9P18340 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Cxcl9P18340 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cxcl9P18340 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cxcl9P18340 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Cxcl9P18340 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cxcl9P18340 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cxcl9P18340 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Cxcl9P18340 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cxcl9P18340 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cxcl9P18340 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cxcl9P18340 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cxcl9P18340 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cxcl9P18340 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cxcl9P18340 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cxcl9P18340 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cxcl9P18340 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cxcl9P18340 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Cxcl9P18340 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cxcl9P18340 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms