Protein–RNA interactions for Protein: P16460

Ass1, Argininosuccinate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ass1P16460 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ass1P16460 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ass1P16460 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ass1P16460 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ass1P16460 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ass1P16460 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ass1P16460 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ass1P16460 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ass1P16460 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ass1P16460 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ass1P16460 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ass1P16460 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ass1P16460 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ass1P16460 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ass1P16460 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ass1P16460 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ass1P16460 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ass1P16460 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ass1P16460 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ass1P16460 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ass1P16460 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ass1P16460 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ass1P16460 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ass1P16460 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ass1P16460 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ass1P16460 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ass1P16460 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ass1P16460 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ass1P16460 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ass1P16460 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ass1P16460 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ass1P16460 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ass1P16460 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ass1P16460 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ass1P16460 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ass1P16460 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ass1P16460 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ass1P16460 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ass1P16460 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ass1P16460 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ass1P16460 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ass1P16460 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ass1P16460 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ass1P16460 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ass1P16460 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ass1P16460 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ass1P16460 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ass1P16460 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ass1P16460 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ass1P16460 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ass1P16460 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ass1P16460 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ass1P16460 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ass1P16460 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ass1P16460 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ass1P16460 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ass1P16460 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ass1P16460 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ass1P16460 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ass1P16460 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ass1P16460 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ass1P16460 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ass1P16460 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ass1P16460 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ass1P16460 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ass1P16460 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ass1P16460 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ass1P16460 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ass1P16460 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ass1P16460 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ass1P16460 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ass1P16460 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ass1P16460 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ass1P16460 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ass1P16460 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ass1P16460 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ass1P16460 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ass1P16460 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ass1P16460 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ass1P16460 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Ass1P16460 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ass1P16460 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ass1P16460 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ass1P16460 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ass1P16460 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ass1P16460 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ass1P16460 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ass1P16460 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ass1P16460 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ass1P16460 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ass1P16460 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ass1P16460 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ass1P16460 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ass1P16460 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ass1P16460 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ass1P16460 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ass1P16460 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ass1P16460 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ass1P16460 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ass1P16460 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms