Protein–RNA interactions for Protein: P11403

Fgf4, Fibroblast growth factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf4P11403 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Fgf4P11403 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Fgf4P11403 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fgf4P11403 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fgf4P11403 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fgf4P11403 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fgf4P11403 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fgf4P11403 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fgf4P11403 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fgf4P11403 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fgf4P11403 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fgf4P11403 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fgf4P11403 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fgf4P11403 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fgf4P11403 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fgf4P11403 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fgf4P11403 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fgf4P11403 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fgf4P11403 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fgf4P11403 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fgf4P11403 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fgf4P11403 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fgf4P11403 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fgf4P11403 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fgf4P11403 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fgf4P11403 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fgf4P11403 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Fgf4P11403 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fgf4P11403 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fgf4P11403 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fgf4P11403 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fgf4P11403 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fgf4P11403 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fgf4P11403 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fgf4P11403 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fgf4P11403 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fgf4P11403 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fgf4P11403 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fgf4P11403 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fgf4P11403 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fgf4P11403 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fgf4P11403 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Fgf4P11403 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fgf4P11403 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fgf4P11403 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fgf4P11403 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fgf4P11403 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Fgf4P11403 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fgf4P11403 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fgf4P11403 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fgf4P11403 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fgf4P11403 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fgf4P11403 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Fgf4P11403 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fgf4P11403 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fgf4P11403 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fgf4P11403 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fgf4P11403 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fgf4P11403 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fgf4P11403 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fgf4P11403 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fgf4P11403 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Fgf4P11403 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fgf4P11403 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fgf4P11403 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fgf4P11403 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fgf4P11403 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fgf4P11403 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fgf4P11403 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fgf4P11403 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fgf4P11403 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fgf4P11403 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fgf4P11403 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fgf4P11403 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fgf4P11403 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fgf4P11403 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fgf4P11403 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fgf4P11403 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fgf4P11403 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fgf4P11403 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fgf4P11403 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fgf4P11403 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fgf4P11403 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Fgf4P11403 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fgf4P11403 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fgf4P11403 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fgf4P11403 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fgf4P11403 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fgf4P11403 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fgf4P11403 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fgf4P11403 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fgf4P11403 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fgf4P11403 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fgf4P11403 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fgf4P11403 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fgf4P11403 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fgf4P11403 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fgf4P11403 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fgf4P11403 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fgf4P11403 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms