Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxd4P10628 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxd4P10628 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxd4P10628 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxd4P10628 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxd4P10628 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxd4P10628 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxd4P10628 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxd4P10628 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxd4P10628 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxd4P10628 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxd4P10628 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxd4P10628 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxd4P10628 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxd4P10628 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxd4P10628 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxd4P10628 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxd4P10628 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxd4P10628 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxd4P10628 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxd4P10628 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxd4P10628 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxd4P10628 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxd4P10628 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hoxd4P10628 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxd4P10628 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxd4P10628 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxd4P10628 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxd4P10628 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxd4P10628 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxd4P10628 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxd4P10628 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxd4P10628 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxd4P10628 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxd4P10628 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxd4P10628 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxd4P10628 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxd4P10628 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxd4P10628 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxd4P10628 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxd4P10628 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxd4P10628 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxd4P10628 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxd4P10628 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxd4P10628 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxd4P10628 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxd4P10628 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxd4P10628 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxd4P10628 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxd4P10628 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxd4P10628 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxd4P10628 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxd4P10628 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxd4P10628 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxd4P10628 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxd4P10628 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxd4P10628 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxd4P10628 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxd4P10628 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxd4P10628 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxd4P10628 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxd4P10628 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxd4P10628 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxd4P10628 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxd4P10628 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxd4P10628 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxd4P10628 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxd4P10628 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxd4P10628 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Hoxd4P10628 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxd4P10628 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxd4P10628 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxd4P10628 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxd4P10628 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxd4P10628 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxd4P10628 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxd4P10628 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxd4P10628 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxd4P10628 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxd4P10628 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxd4P10628 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxd4P10628 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxd4P10628 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxd4P10628 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxd4P10628 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxd4P10628 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxd4P10628 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxd4P10628 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxd4P10628 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxd4P10628 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxd4P10628 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxd4P10628 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxd4P10628 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxd4P10628 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxd4P10628 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxd4P10628 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxd4P10628 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxd4P10628 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxd4P10628 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxd4P10628 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms