Protein–RNA interactions for Protein: P10148

Ccl2, C-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl2P10148 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccl2P10148 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccl2P10148 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccl2P10148 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccl2P10148 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccl2P10148 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccl2P10148 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccl2P10148 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccl2P10148 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccl2P10148 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccl2P10148 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccl2P10148 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccl2P10148 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccl2P10148 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccl2P10148 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccl2P10148 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccl2P10148 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccl2P10148 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccl2P10148 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccl2P10148 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccl2P10148 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccl2P10148 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccl2P10148 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccl2P10148 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccl2P10148 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccl2P10148 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccl2P10148 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccl2P10148 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccl2P10148 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccl2P10148 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccl2P10148 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccl2P10148 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccl2P10148 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccl2P10148 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccl2P10148 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccl2P10148 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccl2P10148 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccl2P10148 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccl2P10148 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccl2P10148 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccl2P10148 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccl2P10148 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccl2P10148 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccl2P10148 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccl2P10148 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccl2P10148 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccl2P10148 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccl2P10148 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccl2P10148 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccl2P10148 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccl2P10148 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccl2P10148 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccl2P10148 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccl2P10148 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccl2P10148 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccl2P10148 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccl2P10148 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccl2P10148 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccl2P10148 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccl2P10148 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccl2P10148 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccl2P10148 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccl2P10148 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccl2P10148 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccl2P10148 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccl2P10148 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccl2P10148 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccl2P10148 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccl2P10148 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccl2P10148 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccl2P10148 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccl2P10148 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccl2P10148 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccl2P10148 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccl2P10148 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccl2P10148 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccl2P10148 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccl2P10148 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccl2P10148 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccl2P10148 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccl2P10148 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccl2P10148 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccl2P10148 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccl2P10148 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccl2P10148 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccl2P10148 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccl2P10148 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccl2P10148 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccl2P10148 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccl2P10148 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccl2P10148 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccl2P10148 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccl2P10148 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccl2P10148 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccl2P10148 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccl2P10148 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccl2P10148 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccl2P10148 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccl2P10148 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccl2P10148 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms