Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Schip1P0DPB4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Schip1P0DPB4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Schip1P0DPB4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Schip1P0DPB4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Schip1P0DPB4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Schip1P0DPB4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Schip1P0DPB4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Schip1P0DPB4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Schip1P0DPB4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Schip1P0DPB4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Schip1P0DPB4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Schip1P0DPB4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Schip1P0DPB4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Schip1P0DPB4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Schip1P0DPB4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Schip1P0DPB4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Schip1P0DPB4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Schip1P0DPB4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Schip1P0DPB4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Schip1P0DPB4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Schip1P0DPB4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Schip1P0DPB4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Schip1P0DPB4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Schip1P0DPB4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Schip1P0DPB4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Schip1P0DPB4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Schip1P0DPB4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Schip1P0DPB4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Schip1P0DPB4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Schip1P0DPB4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Schip1P0DPB4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Schip1P0DPB4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Schip1P0DPB4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Schip1P0DPB4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Schip1P0DPB4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Schip1P0DPB4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Schip1P0DPB4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Schip1P0DPB4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Schip1P0DPB4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Schip1P0DPB4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Schip1P0DPB4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Schip1P0DPB4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Schip1P0DPB4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Schip1P0DPB4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Schip1P0DPB4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Schip1P0DPB4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Schip1P0DPB4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Schip1P0DPB4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Schip1P0DPB4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Schip1P0DPB4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Schip1P0DPB4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Schip1P0DPB4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Schip1P0DPB4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Schip1P0DPB4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Schip1P0DPB4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Schip1P0DPB4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Schip1P0DPB4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Schip1P0DPB4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Schip1P0DPB4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Schip1P0DPB4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Schip1P0DPB4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Schip1P0DPB4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Schip1P0DPB4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Schip1P0DPB4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Schip1P0DPB4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Schip1P0DPB4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Schip1P0DPB4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Schip1P0DPB4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Schip1P0DPB4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Schip1P0DPB4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Schip1P0DPB4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Schip1P0DPB4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Schip1P0DPB4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Schip1P0DPB4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Schip1P0DPB4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Schip1P0DPB4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Schip1P0DPB4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Schip1P0DPB4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Schip1P0DPB4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Schip1P0DPB4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Schip1P0DPB4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Schip1P0DPB4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Schip1P0DPB4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Schip1P0DPB4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Schip1P0DPB4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Schip1P0DPB4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Schip1P0DPB4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Schip1P0DPB4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Schip1P0DPB4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Schip1P0DPB4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Schip1P0DPB4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Schip1P0DPB4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Schip1P0DPB4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Schip1P0DPB4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Schip1P0DPB4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Schip1P0DPB4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Schip1P0DPB4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Schip1P0DPB4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Schip1P0DPB4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms