Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Amd1P0DMN7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Amd1P0DMN7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Amd1P0DMN7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Amd1P0DMN7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Amd1P0DMN7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Amd1P0DMN7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Amd1P0DMN7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Amd1P0DMN7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Amd1P0DMN7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Amd1P0DMN7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Amd1P0DMN7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Amd1P0DMN7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Amd1P0DMN7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Amd1P0DMN7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Amd1P0DMN7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Amd1P0DMN7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Amd1P0DMN7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Amd1P0DMN7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Amd1P0DMN7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Amd1P0DMN7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Amd1P0DMN7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Amd1P0DMN7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Amd1P0DMN7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Amd1P0DMN7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Amd1P0DMN7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Amd1P0DMN7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Amd1P0DMN7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Amd1P0DMN7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Amd1P0DMN7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Amd1P0DMN7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Amd1P0DMN7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Amd1P0DMN7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Amd1P0DMN7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Amd1P0DMN7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Amd1P0DMN7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Amd1P0DMN7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Amd1P0DMN7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Amd1P0DMN7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Amd1P0DMN7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Amd1P0DMN7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Amd1P0DMN7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Amd1P0DMN7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Amd1P0DMN7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Amd1P0DMN7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Amd1P0DMN7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Amd1P0DMN7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Amd1P0DMN7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Amd1P0DMN7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Amd1P0DMN7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Amd1P0DMN7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Amd1P0DMN7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Amd1P0DMN7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Amd1P0DMN7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Amd1P0DMN7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Amd1P0DMN7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Amd1P0DMN7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Amd1P0DMN7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Amd1P0DMN7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Amd1P0DMN7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Amd1P0DMN7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Amd1P0DMN7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Amd1P0DMN7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Amd1P0DMN7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Amd1P0DMN7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Amd1P0DMN7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Amd1P0DMN7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Amd1P0DMN7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Amd1P0DMN7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Amd1P0DMN7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Amd1P0DMN7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Amd1P0DMN7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Amd1P0DMN7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Amd1P0DMN7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Amd1P0DMN7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Amd1P0DMN7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Amd1P0DMN7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Amd1P0DMN7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Amd1P0DMN7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Amd1P0DMN7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Amd1P0DMN7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Amd1P0DMN7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Amd1P0DMN7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Amd1P0DMN7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Amd1P0DMN7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Amd1P0DMN7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Amd1P0DMN7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Amd1P0DMN7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Amd1P0DMN7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Amd1P0DMN7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Amd1P0DMN7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Amd1P0DMN7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Amd1P0DMN7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Amd1P0DMN7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Amd1P0DMN7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Amd1P0DMN7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Amd1P0DMN7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Amd1P0DMN7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Amd1P0DMN7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Amd1P0DMN7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms