Protein–RNA interactions for Protein: P0C242

Ccno, Cyclin-O, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnoP0C242 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CcnoP0C242 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CcnoP0C242 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CcnoP0C242 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CcnoP0C242 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CcnoP0C242 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CcnoP0C242 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CcnoP0C242 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CcnoP0C242 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CcnoP0C242 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CcnoP0C242 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CcnoP0C242 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CcnoP0C242 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CcnoP0C242 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CcnoP0C242 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CcnoP0C242 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CcnoP0C242 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CcnoP0C242 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CcnoP0C242 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CcnoP0C242 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CcnoP0C242 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CcnoP0C242 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CcnoP0C242 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CcnoP0C242 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CcnoP0C242 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CcnoP0C242 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CcnoP0C242 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CcnoP0C242 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CcnoP0C242 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CcnoP0C242 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CcnoP0C242 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CcnoP0C242 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CcnoP0C242 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CcnoP0C242 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CcnoP0C242 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CcnoP0C242 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CcnoP0C242 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CcnoP0C242 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CcnoP0C242 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CcnoP0C242 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CcnoP0C242 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CcnoP0C242 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CcnoP0C242 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CcnoP0C242 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CcnoP0C242 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CcnoP0C242 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CcnoP0C242 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CcnoP0C242 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CcnoP0C242 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CcnoP0C242 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CcnoP0C242 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CcnoP0C242 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CcnoP0C242 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CcnoP0C242 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CcnoP0C242 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CcnoP0C242 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CcnoP0C242 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CcnoP0C242 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CcnoP0C242 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CcnoP0C242 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CcnoP0C242 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CcnoP0C242 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CcnoP0C242 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CcnoP0C242 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CcnoP0C242 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CcnoP0C242 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CcnoP0C242 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CcnoP0C242 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CcnoP0C242 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CcnoP0C242 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CcnoP0C242 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CcnoP0C242 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CcnoP0C242 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CcnoP0C242 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CcnoP0C242 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CcnoP0C242 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CcnoP0C242 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CcnoP0C242 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CcnoP0C242 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CcnoP0C242 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CcnoP0C242 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CcnoP0C242 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CcnoP0C242 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CcnoP0C242 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CcnoP0C242 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CcnoP0C242 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CcnoP0C242 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CcnoP0C242 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CcnoP0C242 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CcnoP0C242 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CcnoP0C242 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CcnoP0C242 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CcnoP0C242 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CcnoP0C242 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CcnoP0C242 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CcnoP0C242 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CcnoP0C242 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CcnoP0C242 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CcnoP0C242 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CcnoP0C242 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.1 ms