Protein–RNA interactions for Protein: P09024

Hoxb7, Homeobox protein Hox-B7, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb7P09024 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
Hoxb7P09024 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Hoxb7P09024 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Hoxb7P09024 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Hoxb7P09024 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Hoxb7P09024 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Hoxb7P09024 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Hoxb7P09024 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Hoxb7P09024 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Hoxb7P09024 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Hoxb7P09024 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Hoxb7P09024 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Hoxb7P09024 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Hoxb7P09024 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Hoxb7P09024 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Hoxb7P09024 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Hoxb7P09024 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Hoxb7P09024 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Hoxb7P09024 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Hoxb7P09024 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Hoxb7P09024 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Hoxb7P09024 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Hoxb7P09024 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Hoxb7P09024 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
Hoxb7P09024 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Hoxb7P09024 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Hoxb7P09024 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Hoxb7P09024 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Hoxb7P09024 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Hoxb7P09024 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Hoxb7P09024 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Hoxb7P09024 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Hoxb7P09024 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Hoxb7P09024 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Hoxb7P09024 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Hoxb7P09024 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Hoxb7P09024 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Hoxb7P09024 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
Hoxb7P09024 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Hoxb7P09024 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
Hoxb7P09024 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Hoxb7P09024 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Hoxb7P09024 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Hoxb7P09024 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Hoxb7P09024 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Hoxb7P09024 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Hoxb7P09024 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Hoxb7P09024 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Hoxb7P09024 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Hoxb7P09024 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Hoxb7P09024 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Hoxb7P09024 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Hoxb7P09024 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Hoxb7P09024 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Hoxb7P09024 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Hoxb7P09024 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Hoxb7P09024 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Hoxb7P09024 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Hoxb7P09024 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Hoxb7P09024 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Hoxb7P09024 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Hoxb7P09024 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Hoxb7P09024 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Hoxb7P09024 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Hoxb7P09024 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Hoxb7P09024 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Hoxb7P09024 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Hoxb7P09024 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Hoxb7P09024 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Hoxb7P09024 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Hoxb7P09024 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Hoxb7P09024 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Hoxb7P09024 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Hoxb7P09024 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Hoxb7P09024 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Hoxb7P09024 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Hoxb7P09024 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Hoxb7P09024 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Hoxb7P09024 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Hoxb7P09024 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Hoxb7P09024 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Hoxb7P09024 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Hoxb7P09024 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Hoxb7P09024 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Hoxb7P09024 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Hoxb7P09024 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Hoxb7P09024 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Hoxb7P09024 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Hoxb7P09024 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Hoxb7P09024 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Hoxb7P09024 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Hoxb7P09024 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Hoxb7P09024 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Hoxb7P09024 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Hoxb7P09024 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Hoxb7P09024 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Hoxb7P09024 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Hoxb7P09024 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Hoxb7P09024 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Hoxb7P09024 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms